9tqb

Octameric C. elegans BORC, containing BORCS5, BORCS6, BORCS7, BORCS8, KXD1 and the shared BORC and BLoC-1 subunits, BLOC1S1, BLOC1S2 and Snapin

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1

Caenorhabditis elegans

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	BL1S1_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2

Caenorhabditis elegans

UniProt Q95XD3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	BL1S2_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

SNAPIN protein homolog

Caenorhabditis elegans

UniProt O44445

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SNAPN_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

KxDL domain-containing protein

Caenorhabditis

UniProt O01488

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O01488_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

BLOC-1-related complex subunit 5

Caenorhabditis elegans

UniProt O01902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O01902_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein

Caenorhabditis elegans

UniProt Q9TYN4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9TYN4_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

BLOC-1-related complex subunit 7

Caenorhabditis elegans

UniProt Q21655

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 8 homolog × 1 （O45685）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q21655_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126

BLOC-1-related complex subunit 8 homolog

Caenorhabditis elegans

UniProt O45685

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1 × 1 （Q22616） Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2 × 1 （Q95XD3） SNAPIN protein homolog × 1 （O44445） KxDL domain-containing protein × 1 （O01488） BLOC-1-related complex subunit 5 × 1 （O01902） BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein × 1 （Q9TYN4） BLOC-1-related complex subunit 7 × 1 （Q21655）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	BORC8_CAEEL
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9tqb
沉积日期 deposition_date	2025-12-19
结构标题 title	Octameric C. elegans BORC, containing BORCS5, BORCS6, BORCS7, BORCS8, KXD1 and the shared BORC and BLoC-1 subunits, BLOC1S1, BLOC1S2 and Snapin
关键词 keywords	BORC, BLOC-1, lysosome, recycling endosome, EARP, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9tqb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9tqb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9tqb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	63.35 Å
Rg（电子密度）	67.48 Å
总 Rg	66.20 Å
原子数	11843
残基数	749
排除体积	104690 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9tqb__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1
分子量 formula_weight	14698.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G
原子数 atom_count	11843

MLKEHSKKQHLRREVQEKLKNEAIVAAQTLSTAVVDHLNAKVAQAYGNQKRLDVEAKRFENNSAALAKQTEQWLFITEGLNYALKEIGDVENWSKTIENDMKIITETLRRAYEAKNPPLPPNQANPASH

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2
分子量 formula_weight	15013.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAEINERASTSSPPVPSTPAPVPHIRQLADNMTDKVGQFFQHQLEGSIEEYKLLETMNNTTAQRYVDMKVVAEKVAGKLDNLNQKYENLRPYLSQIDAMDESTRRLEEATAVLENYVTQLESKLTNIQQQSQ

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	SNAPIN protein homolog
分子量 formula_weight	13837.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSSTAGGEVSINSGDLLLGTLSTSITKLEQQIRATQLSQKKLNSDCETMAEYLRDLSEYKQPVDLLPYVGKLNDSTIRVNNTHQKLDDLLERLTKLQRQIARETYKKKNSIKEQEPPVQPEN

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	KxDL domain-containing protein
分子量 formula_weight	16295.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAEKNHQQQERLPGNPFFPSRSNAGSSFDMPETPHLIDSLTSQIDEFTIQSIIDTQRQSLKRFEKTNEMLMNCAQLGDRRIEKAKRDSVGHKETILQMKTDLEFIFKKIRMFKTVLSSKYPEVYAEVSAELTPKRSEEDE

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6237
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	BLOC-1-related complex subunit 5
分子量 formula_weight	26732.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MANEQSSSTAGTSSNPQNQQSSFSFLTRASTKRSKGIITVKDGNIPQEKLEDDEIYKRFTEIPRFLPVIPAVIGKRDPQTNQGASYTHQKISSRPFFRLATRLQEHFAVNAKAVAADQAKIPATCKSVEAKMIRLIEETRAHKEQHDGFMAALSGLNQLHEDICSIQIILEDIVPMVETLNEILTPDERLPPLNLGSVLDRSPVPSSDSSLQSTPRHNQNIGHIDQIEPIEEIRVVDLPK

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein
分子量 formula_weight	18177.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSTSTESPDTPTTSQPLLSNKQTSFVVDDLEERIRESARISSPKRAAAAGLPDPKILVDLETHTKEIVNNMDTMLRDMRGSLHGMSDLTLESLQCYNSGVEKACDEADANVKSTYAMLAKVEEVNQSMGNVQKLAGQIKEMRRLVELFETLFHGSLKENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	BLOC-1-related complex subunit 7
分子量 formula_weight	13864.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSISLESKTKLPQKILEIITDGSALLSIPMSSSQASETLLTSAKQFSHVEQVIDNTDKLLREIEQMVDGVTKNAEDMEKGLDIVCDVQECLQKVERQNYYSAVPKSFSADSFSSSVAGERPNPPNN

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	BLOC-1-related complex subunit 8 homolog
分子量 formula_weight	16878.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MPDPSSTPNRTREIESRSRIISERICESVRLLDNEPSLALYRLQEHTVRSLPGLVNRRIMLTQQSATLSGAQFDLENTLSTTTSMQNATSAFDNCIELLRNCMFYKQQLDFDSTRKATSSAESSTVKGRSKSLHNVATRVHSTEASTSNDA

来源 Source

来源生物 organism	Caenorhabditis elegans
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6239
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	7.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	201956

Octameric C. elegans BORC, containing BORCS5, BORCS6, BORCS7, BORCS8, KXD1 and the shared BORC and BLoC-1 subunits, BLOC1S1, BLOC1S2 and Snapin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SNAPIN protein homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

KxDL domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BLOC-1-related complex subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BLOC-1-related complex subunit 6 C-terminal helix domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BLOC-1-related complex subunit 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BLOC-1-related complex subunit 8 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9tqb__assembly_1__model_1

9tqb__assembly_1__model_1 | I(q)

9tqb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer