Escherichia coli APEC O1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | ;[[(2R,3S,5R)-5-[4-azanyl-5-(hydroxymethyl)-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate ; × 4 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | A0A0H2Z2I3_ECOK1 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–262； UniProt 1–257 |
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| 条目编号 entry_id | 9u7z |
| 沉积日期 deposition_date | 2025-03-25 |
| 结构标题 title | 5hmC specific restriction endonuclease Escherichia coli APEC O1 PD-T4-3 in complex with 5-Hydroxymethyl-dCTP |
| 关键词 keywords | Restriction endonuclease, defense system, GIY-YIG, PD-T4-3, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 31.95 Å |
| Rg（电子密度） | 31.06 Å |
| 总 Rg | 31.75 Å |
| 原子数 | 15804 |
| 残基数 | 984 |
| 排除体积 | 141380 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |