SAXSdb — 9v7l

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glr1262 protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Phycocyanin-associated rod linker protein × 1 Phycocyanin beta chain × 12 （Q7M7C7） Phycocyanin alpha chain × 12 （Q7M7F7） Phycocyanin-associated rod linker protein × 1 PHYCOCYANOBILIN × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7NL64_GLOVI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–824； UniProt 1–824

Phycocyanin beta chain

物种未注明

UniProt Q7M7C7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Glr1262 protein × 1 （Q7NL64） Phycocyanin-associated rod linker protein × 1 Phycocyanin alpha chain × 12 （Q7M7F7） Phycocyanin-associated rod linker protein × 1 PHYCOCYANOBILIN × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7M7C7_GLOVI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 D； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 F； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 H； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 J； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 L； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 O； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 Q； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 S； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 U； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 W； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 Y； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

Phycocyanin alpha chain

物种未注明

UniProt Q7M7F7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	Glr1262 protein × 1 （Q7NL64） Phycocyanin-associated rod linker protein × 1 Phycocyanin beta chain × 12 （Q7M7C7） Phycocyanin-associated rod linker protein × 1 PHYCOCYANOBILIN × 36	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7M7F7_GLOVI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 E； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 G； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 I； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 K； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 N； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 P； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 R； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 T； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 V； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 X； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 a； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9v7l
沉积日期 deposition_date	2025-05-28
结构标题 title	Phycobilisome rod R1 from Gloeobacter violaceus PCC 7421
关键词 keywords	Phycobilisome, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9v7l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9v7l__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9v7l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	49.85 Å
Rg（电子密度）	49.20 Å
总 Rg	49.49 Å
原子数	36440
残基数	4570
排除体积	647360 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9v7l__assembly_1__model_1`	27-meric （27）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glr1262 protein
分子量 formula_weight	92127.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	36440

MSTVLDDQSKAYAPGSANGPTAGLEPFVRMSRMIRSGVPEDREEPDELWLSMVRDIFGRGYMDRLSQTRAIDYSAFVRPADQATADGAAQTKLGITAIAPDQGVELRPNFTEADVITVIRAAYKQLFGNTYILESERVIQAESLLRNGSISVREFIRILAKSDLYKERFFRCTSNNRFIELNLKHLLGRAPYNQGEIAEHLDRYCQSGYDAEIDSYIDSDEYRRVFGENTVPYFRGFKYQVGQSAAAFERMRALYSGDAGSDTDRNQNGQRTELTSGLADPAQPVRARTDYALTRVDIPGGNGAAGRLAALDESLGSWLDAARDLISQNDYSQKAIEVEPKRVAPYAQYLTPAVEATPDAAAQTKLGITAVAPDQAVELRPNFGEAEVQAVIRAAYKQIFGNTYILEADRVVIAESLLRNGSISVREFVRLLAKSDLYRDRFFRTASNNRFIELNFKHFLGRAPYSQAEIGEHFNRYHKSGYDAEIDSYIDSDEYRRVFGENTVPYFRGFKYQVGQAARGFDQMQQLFAGDAGSDTDRGIGAQPAAKLTFPLSRPLGVTSAYFPSSQGGAATSDGLEMFTRMARELTVTPVSARRTTSPTAPTAPAMPLAGYYSRPAPRATADGDAQTKLGITAVAPAQAVELRPNFGETELQAVIRATYKQLFGNTYILEADRVVQAESLLRNGSINVREFVRLLAKSELYKERFFHCTSNNRFIELTFKHLLGRAPYNQSEFVEHLDRYQKSGYDAEIDSYIDSDEYRRVFGENTVPYFRGFKYQTGQAAGVFERTLKLYGGDADSDTNRNRQGQLRQVDPQELLRSGRGIV

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Phycocyanin-associated rod linker protein
分子量 formula_weight	31085.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MSVLTGDNQQRGSKLFKITIALSPTLAHHPWPGLDTHEPSQSSYSTIVSLERLLPEMTRIKRNGGRILEITEGEASESRANFPAVMEPPVVELYPRAGEAEVQAVIAVAYKQVFGNIHVMESERIVSAESLLRNRSISVREFVRLLAKSDLYKESFFHCTSNNRFIELNFKHLLGRAPYNHSEIIEHLDRYQSQGYDAEIDSYIDSDEYVKTFGENVVPYHRGFKSQVGQQSVAAFERMIRLFGGDASSDTSLNRTGQKRLVDPKQLLRSGRGIV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phycocyanin beta chain
分子量 formula_weight	18479.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,O,Q,S,U,W,Y

MQDAFTKAIVAADLRGSFLSEQELNQLTNLVKESNKRLDAVNAITGNAAEIISDAAHKLFAEQTDLIRPGGNAYPNRRMAACLRDMEIILRYVSYALLAGDASVLEDRCLNGLKETYVALGTPTRSVARAVQLMKETAIGYVNSPSGVTRGDCSALVNEAATYFDKAAASIA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Phycocyanin alpha chain
分子量 formula_weight	17679.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,E,G,I,K,N,P,R,T,V,X,a

MKTVITEVIASADSQGRFLNNTELQAANGRFQRATASMEAARALTSNADSLVKGAVQEVYNKFPYLTQPGQMGYGDTNQAKCARDISHYLRFITYSLVAGGTGPLDDYIVAGLREVNRTFNLSPSWYIEALKHIKGKVGSQLSGQPLTEANAYIDYCINALS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Phycocyanin-associated rod linker protein
分子量 formula_weight	30913.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MNVLTTSSQRGGKLFKVTMTLSPALSHHPWPSLDTYEPSQNSYSVVVPLDRLLAEMTYIKNKGGRVLDISPADLEALGPPDISSVAIPLKVELWAKADVSDVQAAIVAAYKQIFGNTYVLESERLTSAESLLRNGSISVREFVRLLAKSELYKERFFFCTSNNRFTELNFKHFLGRAPYNQSEIAAHLDRYQTFGYDAEIDSYIDSDEYIQAFGENVVPYYRGFKSQSGQTVESFNRMFKLYRGDAGSDTNLNLQGQKRRVDPKNLLRSGRGIV

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PHYCOCYANOBILIN
分子量 formula_weight	588.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	36

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.760 Å
最低分辨率 resolution_low	3.760 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.4228
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.76 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	746972

Phycobilisome rod R1 from Gloeobacter violaceus PCC 7421

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glr1262 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phycocyanin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phycocyanin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9v7l__assembly_1__model_1

9v7l__assembly_1__model_1 | I(q)

9v7l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Phycobilisome rod R1 from Gloeobacter violaceus PCC 7421

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glr1262 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phycocyanin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phycocyanin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9v7l__assembly_1__model_1

9v7l__assembly_1__model_1 | I(q)

9v7l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

7. 引用文献 (1)