SAXSdb — 9w7x

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Piezo-type mechanosensitive ion channel component

Drosophila

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	;(9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL ; × 12 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 3 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PIEZO_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–2551； UniProt 1–2551 作者链 B； PDB构建体 1–2551； UniProt 1–2551 作者链 C； PDB构建体 1–2551； UniProt 1–2551

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9w7x
沉积日期 deposition_date	2025-08-07
结构标题 title	Cryo-EM structure of dPIEZO channel
关键词 keywords	dPIEZO channel, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9w7x__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9w7x__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9w7x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.54 Å
Rg（电子密度）	64.41 Å
总 Rg	64.47 Å
原子数	31971
残基数	3915
排除体积	585570 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9w7x__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Piezo-type mechanosensitive ion channel component
分子量 formula_weight	289746.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A,C
原子数 atom_count	31971

MVFSYACMVLQRIVVPAVLVLAALMRPVGISFVYLLMFFVSPFVPLATRRNFKGSVTAFFIILLTLSTLVLLGHITLQILAVSLTLPIYNCSFSERLLRHIGFVSFIDLQPFAIIEWLVPEVLVFATSLGSYLTVKRVASQPVGAEQLENGEVVDGQAENAQTSSQPSAADANGGDVQQATVTTPLQQQQQQLRKRVSMISQHIHFEGLVKISPLFCLATLFFAAVLRPSVPGGFYFLIFLLSGTYWATCQTLQRGFALLLRCVMVVLVLHSLSIVSYQTPWMQSHLNHTTLTARLIGLEPLIESYCSPDIRVFLYNNKLSLDSYLNPFALFFAYFALALTTKHLIKPRLVRQSTRKARTPQPLESGSSVAPSVTQRGNDMQLESMEQRSEQENTTTSILDQISYGFVSVGGFIYQNSYIFTNILMMAWSIVYHSWLTFVLLLSANVLWMIPNQRKAMMRSSPFIVLYAEALLIAQYIYGMDLNNEELPTSVPTAGINLQQIGFERPIENQMRPCVPLIVKTAFVLMFWVTSRQFFKEKRDRRRDSTLADFIAPLQITVGSAGSSYLINDGKKTSKFLKKAGDVIKNLLVRLWIWLLVLVIFLCAITGENMTGFRICYMALFLFFLLVFQSSSKAWVKIMYGFWLFLIFYAMSILILIYTYQFDKFDTYWSDYLNVSATLQKDIGLKRYQTKDLFLHLVSPTIIVILTVIQVHYFHKRFIASLQQQPLAGGSAQQKPTETTALEPAPSKRRGSAGSLRKSQGPSAEAAPGATTDFETSVRDLVRISFRKIKNKSEYIFKNFKDVFWRFLELHIMKAVYIAAFVCSVSEVCVLHIIFVGFCVLGATSRKAVQVVISRLISFIVTVIVLSKMIYQIEYLSHSQHNVVCSDNRTANNAEWIGLTKADKVTGGLMSLLRTYIIYMVIVTMHAVISLRQLQMRVKIGALNAPPTKLLFPNIIRADAEKDLVGLVKYLLNFGFYKFGIEISLIALVSTITYRQDIVAVVYALWLVVLLLLRRSQCAKIWGVFQAFFAISILTQYIVLVGLPPSSCLVFPWDEGPFGEGIQRWAMLPGALHFNHVPKLIFDFIVLVILNRQKSIFCIEQRYASNDDYPGGSNRSVIADIAQLGRVPFDNPTHDFCSYIRNYSDILKNGVLCGFYWFTLAVVFLAGTNIADLLALGYLIGAFIFLWQGSDFYLRPIHTIIFRWKWLLAFNVANILIKTSFQMAGCLFMTQLTKDCCWLVHMLGITCTSNVLTEQIMLPEEAELALKPGECPKITHQVVLLWDTICFAFIIFQLRIFKSHYFCHIITDTKANNILASRGADIIESLRHKQIAHRHDHEKQVLHKIKRKMERIRATQQKMLRPLDKQTHFDEHGYPLPAPTVRRRKEIKLHPHATRAGDYYMFEEMDDKFELDLIHDEIDFLEEENITESEMKMQRRKTLYDKSKDAPTGEFPSTSKGISKERDAATASSSASPAPTRDVGDLPVIPPPSTGLGREQTSKETSDSKSKMEVDSGEVTAKDSDEDFDTNPIIRLLEGFLVTLTIRLNRFSRNYRFVNRILAGEKKTLKESSSLNRLGLSSAAAMFHFLKSNLESDESEPPASSSTPRRVVIAPPNATEHSDPTSTTLNTNTTTTPLSPPEPLQPLQPLQPNTTSTPQQQHQHIRAAEEIIELPVDTVDGVAHRKQSINSSPPAKGAGEFNLEEENFAQRDHHIIVEVLISSWYALLANTDLICYIVVFINQVVNASLISLPLPIMVFLWGTLSLPRPTKTFWVTLIAYTQAIVLIKCIFQFKLIWSNYHQLPNQPLTPAKIFGVENKAHYAIYDLILLLVLFLHRYLLKSQGLWKSGYKDTDNQFTKPTASIDERDDSDNLSQPDSRQLNDDAAQKLSLQVSQASLPGSPEFSKTGINQLERTKYTSSLYKFFFSLVHKSRLATDVYALMFLCDFVNFFVLLFGFTAFGTQQTESDEGVQTYLAENKVPIPFLIMLLVQFLLIVIDRALYLRKALVNKIIFHFFSVIGIHIWMFFVVPAVTERTFNSLAPPIIFYVIKCFYMLLSSYQIKSGYPKRILGNFFTKGFSMVNMIAFKVYMQIPFLYELRTILDWVCIDSTMTIFDWLKMEDIFSNIYLIRCTRQSETDFPAMRAQKKASLSKLIMGGTIVLLIVICIWGPLCLFALGNAVGTSNVPFHVSLSIRIGPYDPIYTTNNYDSIFEINPEMYSQMTNAYIKEKQALTFIAGYDATDVAAVRLAGNSPSLWNIAPPDRQRLLNDLRNNHTLKARFSYSLTRKAPAKGLKENVGDEHAISLDESFEGRAALIHMLSETHDVEPIYSNGTTNGTTPEVEEVVVIPGMIPKFIKVLNSGDAAVVSVLSPKHYDYRPLVIKMHRDNETNGLWWEIRDYCNDTFYNETLSKFAYSNCTSGIVMYTFNDKKFPSTFSFLTAGGIIGLYTTFVLLASRFMKSFIGGQNRKIMFEDLPYVDRVLQLCLDIYLVREALEFALEEDLFAKLLFLYRSPETLIKWTRPKEEYVDDDGDTDSIPSRMSVRRPEQLQPQQPQ

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila
通用名 common_name	fruit flies
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7215
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;(9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL ;
分子量 formula_weight	767.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
分子量 formula_weight	744.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine
分子量 formula_weight	792.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.95 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	678118

Cryo-EM structure of dPIEZO channel

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Piezo-type mechanosensitive ion channel component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9w7x__assembly_1__model_1

9w7x__assembly_1__model_1 | I(q)

9w7x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of dPIEZO channel

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Piezo-type mechanosensitive ion channel component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9w7x__assembly_1__model_1

9w7x__assembly_1__model_1 | I(q)

9w7x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)