SAXSdb — 9wvu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-1,4 glucan phosphorylase

Crocosphaera subtropica ATCC 51142

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	同源多聚体	蛋白 2 其他聚合物 5	;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 ;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 2 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B1WXW6_CROS5
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AAA； PDB构建体 16–855； UniProt 1–840 作者链 BBB； PDB构建体 16–855； UniProt 1–840

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9wvu
沉积日期 deposition_date	2025-09-22
最后修订 last_revision	2026-03-18
结构标题 title	Carbohydrate-bound structure of alpha-glucan phosphorylase from Crocosphaera subtropica ATCC 51142
关键词 keywords	Starch, Glycogen, GlycosylTransferase family 35 (GT35) alpha-glucan phosphorylase, CARBOHYDRATE, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9wvu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9wvu__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9wvu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.25 Å
Rg（电子密度）	38.73 Å
总 Rg	39.12 Å
原子数	13500
残基数	1624
排除体积	240600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9wvu__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Alpha-1,4 glucan phosphorylase
分子量 formula_weight	98544.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.1.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AAA,BBB
原子数 atom_count	13591

MNHKVHHHHHHIEGRMINKNPIKVEDDRTGLEIQTLRRAILDNLFYIQGKFPEIATKNDFYLALAYTVRDRLLQRWLNTIQTKLKKDVKKVCYLSAEFLVGPHLENNLINLGIAETIKQAVTESGLNIKELIETEEEPGLGNGGLGRLAACYMDSLSSLEVPAIGYGIRYEFGIFDQEIRDGWQVEITDKWLQYGNPWEICRPEASVTVNFGGHTEQYVDGYDNFHVRWVPEYVVKGIPYDTPITGYKVNTVNTLRLWRSEACESFDFQRFNVGDYYGAVDDKVTSENLTKVLYPNDETTQGKELRLRQQYFFVSSSLQDMTRIHLLNNPNLDNFHEQWAIQLNDTHPAVAVPELMRLLVDVHEYEWGKAWNIVKNTFAYTNHTLLPEALEKWPIELFGSLLPRILEIIYEINRRFLDQVRIKFPNDDSKMASLSIIDESGERYVRMAHLACIGSHHINGVAELHSQLVKDTILHDFYLLSPEKFTNVTNGVTPRRWIVQSNPRLSELITSKIGDGWIKNLPELRKLESYAEDKTFRQQWREAKQAVKQDLANYIQKTVGITVNPESLFDIQVKRIHEYKRQHLNVLHIITLYKWIKSNPNLDIPPRTFIFGGKAAPGYFMAKRIIKLITAVGNVVNNDGDIGDRLKVVFLPDYNVTLGQRVYPAADLSEQISLAGKEASGTGNMKFAMNGALTIGTLDGANIEIRQEVGGENFFLFGLTTPEVLNLKAQGYIPRRYYQSIPELRGVIDLISSGFFSHGDPELFQPIVDNLLYDDPYLVLADYKSYIECQDNISQAYKDQENWSKMSILNAARMSKFSSDRSIQDYCNHIWNAKSVPIELKDYVQGKTQLSVDQF

来源 Source

来源生物 organism	Crocosphaera subtropica ATCC 51142
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	43989
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	990.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1801.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	504.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	666.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	91

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晶胞边长 a length_a	267.238 Å
晶胞边长 b length_b	267.238 Å
晶胞边长 c length_c	204.452 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	50.005 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1738
R_free r_free	0.2267

Carbohydrate-bound structure of alpha-glucan phosphorylase from Crocosphaera subtropica ATCC 51142

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-1,4 glucan phosphorylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9wvu__assembly_1__model_1

9wvu__assembly_1__model_1 | I(q)

9wvu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)

Carbohydrate-bound structure of alpha-glucan phosphorylase from Crocosphaera subtropica ATCC 51142

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-1,4 glucan phosphorylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9wvu__assembly_1__model_1

9wvu__assembly_1__model_1 | I(q)

9wvu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)