9xs9

Crystal structure of a cupin protein (tm1459, R39K/H52A/H54A/H92A/C106E mutant) in ruthenium(p-cymene) bound form

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cupin type-2 domain-containing protein

Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8)

UniProt Q9X1H0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 2 RUTHENIUM ION × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9X1H0_THEMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–118; UniProt 1–114 作者链 B; PDB构建体 5–118; UniProt 1–114

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9xs9
沉积日期 deposition_date2025-11-20
最后修订 last_revision2026-04-29
结构标题 titleCrystal structure of a cupin protein (tm1459, R39K/H52A/H54A/H92A/C106E mutant) in ruthenium(p-cymene) bound form
关键词 keywordsArtificial metalloenzymes, Biocatalysis, Ruthenium(p-cymene), METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9xs9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9xs9__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9xs9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.84 Å
Rg(电子密度)17.27 Å
总 Rg18.32 Å
原子数3690
残基数232
排除体积33442 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9xs9__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)