SAXSdb — 9xus

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic

Arabidopsis thaliana

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic × 2 （P55229） 3-PHOSPHOGLYCERIC ACID × 4 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLGS_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 22–470； UniProt 72–520 作者链 C； PDB构建体 22–470； UniProt 72–520

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic

Arabidopsis thaliana

UniProt P55229

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic × 2 （P55228） 3-PHOSPHOGLYCERIC ACID × 4 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLGL1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 22–477； UniProt 67–522 作者链 D； PDB构建体 22–477； UniProt 67–522

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9xus
沉积日期 deposition_date	2025-11-24
结构标题 title	ATP-bound ADP-Glucose Pyrophosphorylase
关键词 keywords	heterotetramer, ADPG, PLANT PROTEIN, amylosynthesis; PLANT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9xus__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9xus__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9xus__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.53 Å
Rg（电子密度）	35.62 Å
总 Rg	36.27 Å
原子数	13768
残基数	1748
排除体积	244730 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9xus__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic
分子量 formula_weight	51517.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.27
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	13768

MGSHHHHHHHHGSGSGSGSGSVSDSQNSQTCLDPDASSSVLGIILGGGAGTRLYPLTKKRAKPAVPLGANYRLIDIPVSNCLNSNISKIYVLTQFNSASLNRHLSRAYASNMGGYKNEGFVEVLAAQQSPENPNWFQGTADAVRQYLWLFEEHNVLEYLILAGDHLYRMDYEKFIQAHRETDADITVAALPMDEQRATAFGLMKIDEEGRIIEFAEKPKGEHLKAMKVDTTILGLDDQRAKEMPFIASMGIYVVSRDVMLDLLRNQFPGANDFGSEVIPGATSLGLRVQAYLYDGYWEDIGTIEAFYNANLGITKKPVPDFSFYDRSAPIYTQPRYLPPSKMLDADVTDSVIGEGCVIKNCKIHHSVVGLRSCISEGAIIEDSLLMGADYYETATEKSLLSAKGSVPIGIGKNSHIKRAIIDKNARIGDNVKIINSDNVQEAARETDGYFIKSGIVTVIKDALIPTGTVI

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic
分子量 formula_weight	52535.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.27
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MGSWSHPQFEKGSGSGSGSGSSLNSVAGESKVQELETEKRDPRTVASIILGGGAGTRLFPLTKRRAKPAVPIGGAYRLIDVPMSNCINSGINKVYILTQYNSASLNRHLARAYNSNGLGFGDGYVEVLAATQTPGESGKRWFQGTADAVRQFHWLFEDARSKDIEDVLILSGDHLYRMDYMDFIQDHRQSGADISISCIPIDDRRASDFGLMKIDDKGRVISFSEKPKGDDLKAMAVDTTILGLSKEEAEKKPYIASMGVYVFKKEILLNLLRWRFPTANDFGSEIIPFSAKEFYVNAYLFNDYWEDIGTIRSFFEANLALTEHPGAFSFYDAAKPIYTSRRNLPPSKIDNSKLIDSIISHGSFLTNCLIEHSIVGIRSRVGSNVQLKDTVMLGADYYETEAEVAALLAEGNVPIGIGENTKIQECIIDKNARVGKNVIIANSEGIQEADRSSDGFYIRSGITVILKNSVIKDGVVI

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3-PHOSPHOGLYCERIC ACID
分子量 formula_weight	186.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.810 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.81 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	196233

ATP-bound ADP-Glucose Pyrophosphorylase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9xus__assembly_1__model_1

9xus__assembly_1__model_1 | I(q)

9xus__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

ATP-bound ADP-Glucose Pyrophosphorylase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9xus__assembly_1__model_1

9xus__assembly_1__model_1 | I(q)

9xus__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)