SAXSdb — 9ygu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellin

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 33	5,7-diamino-3,5,7,9-tetradeoxy-L-glycero-alpha-L-manno-non-2-ulopyranosonic acid × 231	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B8Q9B9_HELPX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A7； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 BJ； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 CT； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 DN； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 EX； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 FB； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 GQ； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 HL； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 I3； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 JD； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 KE； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 LF； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 MO； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 NI； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 OA； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 PU； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 Q2； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 R4； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 S5； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 TP； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 UH； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 VR； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 WG； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 XM； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 Y1； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 Z9； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 aW； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 bS； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 cV； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 dC； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 e8； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 fK； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509 作者链 g6； PDB构建体 1–508； UniProt 2–509

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ygu
沉积日期 deposition_date	2025-09-29
结构标题 title	Flagella filament structure in H. pylori composed of flagellin FlaA
关键词 keywords	flagellin, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ygu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ygu__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ygu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	82.91 Å
Rg（电子密度）	82.61 Å
总 Rg	82.68 Å
原子数	129921
残基数	16764
排除体积	2223400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9ygu__assembly_1__model_1`	33-meric （33）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.88 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	228410

描述 description	Flagellin
分子量 formula_weight	53067.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	33

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y1,Q2,I3,R4,S5,g6,A7,e8,Z9,OA,FB,dC,JD,KE,LF,WG,UH,NI,BJ,fK,HL,XM,DN,MO,TP,GQ,VR,bS,CT,PU,cV,aW,EX
原子数 atom_count	129921

Flagella filament structure in H. pylori composed of flagellin FlaA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9ygu__assembly_1__model_1

9ygu__assembly_1__model_1 | I(q)

9ygu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Flagella filament structure in H. pylori composed of flagellin FlaA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9ygu__assembly_1__model_1

9ygu__assembly_1__model_1 | I(q)

9ygu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

7. 引用文献 (1)