9z6z

Structure of the resting EcDRT3 reverse transcriptase in complex with its non-coding RNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。

七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。

当前条目的 assembly 组成

Assembly	物理组成	蛋白状态	蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物	数据核对
1	其他组合	异源复合物	12 / 12 / 6 / 0	与全部聚合物一致

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9z6z
沉积日期 deposition_date	2025-11-14
结构标题 title	Structure of the resting EcDRT3 reverse transcriptase in complex with its non-coding RNA
关键词 keywords	DRT3-ncRNA complex, reverse transcriptase, Anti-phage complex, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9z6z__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9z6z__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9z6z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	73.65 Å
Rg（电子密度）	69.42 Å
总 Rg	70.06 Å
原子数	69342
残基数	7104
排除体积	1178800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9z6z__assembly_1__model_1`	30-meric （30）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Drt3a reverse transcriptase protein
分子量 formula_weight	50345.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	69348

MYDQSFNPRTLSRCFKPEDFQKNRALSLDSVREKTIRAAIERFNNGFLGYNLRSSVLRGKKVYWADELADTLVLRKVQSNLSNLYQLKLPSRTMIVDTLNVFLSECSQYKLYRLDIHSFYESFNKDYIFKKIDELERLEMKTKQLLKEFLYSFYLTGGEGIPRGLSISAYLAELLMHDFDNHLKDDKSVFYYARYVDDIVIVTSGFEDSNAFIENVKSILPPGLSFNEGEKYYISDLIPKSANKKNTHHHHHHESPTKLLTFEYLGYDFSVGDKIEECNIRGFYRLIEVDLAHAKANKIKSRIIYSIIDYNKTKDFELLCERLKFLSTNFSILDSGRVLKRLSGIHYNYPLVDARTSRRLAELDLFLRKAVLSSNGKVFFDFHANLNQYKKYRLLKISFVRGHEKRHFFHYSASKMMRIQRCWKYV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Drt3b reverse transcriptase protein
分子量 formula_weight	76426.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I,J,K,L,M

MSKKKEVRVNKKDFNRVLVTETIPYETPIIVSNDGFYNNVVKHQTANDIAKLLTQRVILGERKKGRYTIPYVFKINKNETEFRRLAFPHPISQIEMRDFYLHFNQVMINFCSKSDFSIRRPVKVASTYYYKNLLEDKNLYKRGPVDTDKNELLTRHASSYFGYHGYDRLYKFFMSNDFIDLERKYNTLYTLDVSKCFDSIYTHSISWATKTKTFTKGMLANKSLNFGDAFDKLMQRCNFNETHGVIIGPEISRIFAEIIFQKIDLNVQFKLRNIDTPLNKGVDYDIRRYVDDVFIFSKNEVNAEIIYKVYADKLNEYNMHVNLGKVTKNSRPFITAKTQIIHHVNQKMNVFIDSFLSYDDEMKLIAKPIYNNRKLANKFIDEVKIICSERKSGYGEVSSYIVSAIFERIKRLTSSVNQAEDKDIYNVMYVLLHISLFFFRVAPSVSSSYKLASILIVTLRYFKAQVPSYSDLIASYIYFEIEDFLKAAKNGKKTIDNLVSLEAYNIMYVIGELDQDRYLSKQLVEDVFSEVDSYFDIVSCLYIVKDKKVYDSLKNNIIDVINSKLMSSDNILDYSEKAMLFLDVMSCPYIDLKWKKIWLKSILKELQEATPNNNEIDSFISYSVANPWFVDWSNVDLLNFLEKKQLKKAY

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	non-coding RNA
分子量 formula_weight	44236.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R,S,T,U,V,W

AAUGCAACCAAUAUGCCCUACACGAUUUUUCGAUAUACUAGGGCUGAUUACGGUAGGUAAGUUACACGUAACCUUAGCUACCUUAUGACGCUCAAGAGCAGCAAUGCACACACUAAGGGAUGAGGUUGCUUCAAUUUC

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PTPGPTPGP*T)-3') ;
分子量 formula_weight	3730.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	X,Z,b,d,f,h

TGTGTGTTGTGT

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PAPCPAPCPAPCPAPCPAPCPAPCPAPCPAPCP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	5087.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Y,a,c,e,g,i

ACACACACACACACACA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

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分辨率 resolution	2.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	63349

Structure of the resting EcDRT3 reverse transcriptase in complex with its non-coding RNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

当前条目的 assembly 组成

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9z6z__assembly_1__model_1

9z6z__assembly_1__model_1 | I(q)

9z6z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)