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9z78

Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 15

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 140.6 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine protease EatA

Escherichia coli

UniProt Q84GK0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 57–1087 未记录 Heavy chain of the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 15 × 1 Light chain of the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 15 × 1 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 2.64 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9Z78 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
9Z76 Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 25 提交 2025-11-16 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 57–1087（1031 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.32 Å
9Z77 Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody G12 提交 2025-11-16 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 57–1087（1031 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.70 Å
9Z79 Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 40 提交 2025-11-16 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 57–1087（1031 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.66 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EATA_ECOH1
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1031； UniProt 57–1087

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9z78

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9z78
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9z78
沉积日期 deposition_date2025-11-16
结构标题 titleCryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 15
关键词 keywordsPROTEASE, BETA-HELIX, SECRETED, MONOCLONAL ANTIBODY, HYDROLASE, HYDROLASE-IMMUNE SYSTEM complex; HYDROLASE/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.47 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron41.73 Å
零角强度 I(0) i0279853000.00
分子量 molecular_weight133410.0 kDa
排除体积 excluded_volume165660 ų
包络体积 envelope_volume216260 ų
水化壳体积 shell_volume46189 ų
包络直径 envelope_diameter143.3 Å
壳层 Rg shell_rg42.98 Å
包络 Rg envelope_rg42.27 Å
形状 Rg shape_rg41.70 Å
总 Rg total_rg41.89 Å
总原子数 total_atoms9402
残基数 n_residues1239
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax140.6 Å
Rg (实空间) rg_real41.62 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.51 Å
I(0) (实空间) i0_real2.7990e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.5190e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal279800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8094
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary40.7 Å
偏度 Skewness skewness0.351
峰度 Kurtosis kurtosis-0.595
角度范围 angular_range— – 0.1900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha23670000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.867; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.916; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)