Beta-lactamase OXA-23
Acinetobacter baumannii
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–273 | 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350 | 分辨率 1.65 Å R-free 0.200 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9ZOR | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4JF4 OXA-23 meropenem complex 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–273(243 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;277 K;0.06 M citric acid/0.04 M bis-tris propane, 16 % PEG3350, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.254 |
| 4JF4 OXA-23 meropenem complex 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
31–273(243 aa)
|
未记录 | MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;277 K;0.06 M citric acid/0.04 M bis-tris propane, 16 % PEG3350, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.254 |
| 4JF5 Structure of OXA-23 at pH 4.1 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–273(243 aa)
|
未记录 | FLC CITRATE ANION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;277 K;0.06 M citric acid/0.04 M bis-tris propane, 16 % PEG3350, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.162 |
| 4JF6 Structure of OXA-23 at pH 7.0 提交 2013-02-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–273(243 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | K POTASSIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.2 M succinic acid, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.285 |
| 4K0W X-ray crystal structure of OXA-23 A220 duplication clinical variant 提交 2013-04-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–273(243 aa)
片段:unp residues 31-273
|
突变:A220 insertion | CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 BCT BICARBONATE ION × 4 NA SODIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;296 K;0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate, 0.1M citrate
20% w/v PEG 8000 , pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.202 |
| 4K0X X-ray Crystal Structure of OXA-23 from Acinetobacter baumannii 提交 2013-04-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–273(243 aa)
片段:UNP residues 31-273
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | BCT BICARBONATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;5% w/v PGA-LM, 30% v/v PEG 550MME,0.1M Sodium acetate, OXA-23 in 50 mM sodium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.192 |
| 6N6T OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form 提交 2018-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
31–273(243 aa)
片段:UNP residues 31-273
|
突变:F110A/M221A | FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;0.06 M citric acid, 0.04 M bis-Tris propane, pH 4.1, 16% PEG3350
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.180 |
| 6N6U OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form imipenem complex 提交 2018-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
32–273(242 aa)
片段:UNP residues 32-273
|
突变:F110A/M221A | ID1 Imipenem × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;0.06 M citric acid, 0.04 M bis-Tris propane, pH 4.1, 16% PEG3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.196 |
| 6N6V OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form meropenem complex 提交 2018-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
32–273(242 aa)
片段:UNP residues 32-273
|
突变:F110A/M221A | KE1 meropenem, bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.1;293 K;0.06 M citric acid, 0.04 M bis-Tris propane, pH 4.1, 16% PEG3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.192 |
| 6N6W OXA-23 mutant F110A/M221A neutral pH form 提交 2018-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
36–273(238 aa)
片段:UNP residues 36-273
|
突变:F110A/M221A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2 M succinic acid, pH 7.0, 20% PEG3350
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.290 |
| 6N6X OXA-23 mutant F110A/M221A neutral pH form imipenem complex 提交 2018-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
35–273(239 aa)
片段:UNP residues 35-273
|
突变:F110A/M221A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ID1 Imipenem × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2 M succinic acid, pH 7.0, 20% PEG3350
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.216 |
| 6N6Y OXA-23 mutant F110A/M221A neutral pH form meropenem complex 提交 2018-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
35–273(239 aa)
片段:UNP residues 35-273
|
突变:F110A/M221A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | KE1 meropenem, bound form × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2 M succinic acid, pH 7.0, 20% PEG3350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.300 |
| 9NSW apo-OXA-23, pH 7.5 提交 2025-03-17 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.201 |
| 9NSX OXA-23-NA-1-157, 3 minute soak 提交 2025-03-17 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | Y33 (5R)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-5-methyl-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.205 |
| 9NSY OXA-23-NA-1-157, 4 minute soak 提交 2025-03-17 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | Y33 (5R)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-5-methyl-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.229 |
| 9NSZ OXA-23-NA-1-157, 6 minute soak 提交 2025-03-17 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | Y33 (5R)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-5-methyl-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 9NT0 OXA-23-meropenem, pH 7.5 提交 2025-03-17 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.202 |
| 9ZOP OXA-23-JDB/PQ-1-219, 3 min soak 提交 2025-12-16 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 9ZOQ OXA-23-JDB/PQ-1-219, 5 min soak 提交 2025-12-16 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.234 |
| 9ZOS OXA-23-JDB/PQ-1-219, 20 min complex 提交 2025-12-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
未记录 | A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.229 |
| 9ZOT OXA-23-JDB/PQ-1-219, 30 min complex 提交 2025-12-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.198 |
| 9ZOU OXA-23-JDB/PQ-1-219, 40 min complex 提交 2025-12-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
未记录 | A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 9ZOV OXA-23-JDB/PQ-1-219, 60 min complex 提交 2025-12-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
未记录 | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.227 |
| 9ZOW OXA-23-JDB/PQ-1-219, 90 min complex 提交 2025-12-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–273(273 aa)
|
未记录 | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.230 |
共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | BLO23_ACIBA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–273; UniProt 1–273 |