9zow

OXA-23-JDB/PQ-1-219, 90 min complex

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 77.5 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase OXA-23

Acinetobacter baumannii

UniProt Q9L4P2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–273 未记录 CO2 CARBON DIOXIDE × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350 分辨率 1.70 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BLO23_ACIBA
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–273; UniProt 1–273

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9zow

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9zow
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9zow
沉积日期 deposition_date2025-12-16
最后修订 last_revision2026-01-14
结构标题 titleOXA-23-JDB/PQ-1-219, 90 min complex
关键词 keywordsantibiotic resistance, beta-lactamase, inhibitor, HYDROLASE-INHIBITOR complex; HYDROLASE/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier19.15
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.29
零角强度 I(0) i026081200.00
分子量 molecular_weight26423.0 kDa
排除体积 excluded_volume25680 ų
包络体积 envelope_volume40431 ų
水化壳体积 shell_volume18674 ų
包络直径 envelope_diameter78.4
壳层 Rg shell_rg24.48
包络 Rg envelope_rg18.91
形状 Rg shape_rg18.27
总 Rg total_rg18.99
总原子数 total_atoms2002
残基数 n_residues246
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax77.5
Rg (实空间) rg_real19.17
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.63
I(0) (实空间) i0_real2.6080e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1100e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal19.16
I(0) (倒空间) i0_reciprocal26080000.0000
解质量估计 total_estimate0.5699
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary23.7
偏度 Skewness skewness0.538
峰度 Kurtosis kurtosis0.595
角度范围 angular_range— – 0.4150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha7268000.0000
实空间数据点数 n_real_points73
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.376; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.182; Positv: 1.000; Valcen: 0.742; Smooth: 0.987

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)