当前蛋白身份:A0A024L5V9 重新检索
本组结构的主要差异维度
配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6WTI The Cryo-EM structure of the ubiquinol oxidase from Escherichia coli 提交 2020-05-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–315(315 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HEO HEME O × 1 CU COPPER (II) ION × 1 UQ8 Ubiquinone-8 × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 9 U9V pentadecyl(tetradecyl)peroxyanhydride × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
7N9Z E. coli cytochrome bo3 in MSP nanodisc 提交 2021-06-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 1–315(315 aa)
未记录 UQ8 Ubiquinone-8 × 1 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 9 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEO HEME O × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CDL CARDIOLIPIN × 1 CU COPPER (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
7XMC Cryo-EM structure of Cytochrome bo3 from Escherichia coli, apo structure with DMSO 提交 2022-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–315(315 aa)
未记录 HEO HEME O × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
7XMD Cryo-EM structure of Cytochrome bo3 from Escherichia coli, the structure complexed with an allosteric inhibitor N4 提交 2022-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–315(315 aa)
未记录 HEO HEME O × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2 JYR methyl 3-oxidanyl-5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-1-benzothiophene-2-carboxylate × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å