当前蛋白身份：A0A076Q3N8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6BHJ Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Bound to a 38-mer Hairpin Template-Primer RNA-DNA Aptamer 提交 2017-10-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 待复核 |
链 A
166–722（557 aa）
链 B
168–595（428 aa）
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突变：C280S, D498N 突变：C280S | MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；278 K；10% PEG 8000, 25 mM BisTris-Propane pH 6.8, 75 mM BisTris-Propane pH 7.4, 50 mM Ammonium Sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.244 |
| 6BHJ Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Bound to a 38-mer Hairpin Template-Primer RNA-DNA Aptamer 提交 2017-10-30 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 待复核 |
链 C
166–722（557 aa）
链 D
168–595（428 aa）
|
突变：C280S, D498N 突变：C280S | MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；278 K；10% PEG 8000, 25 mM BisTris-Propane pH 6.8, 75 mM BisTris-Propane pH 7.4, 50 mM Ammonium Sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.244 |
| 6BSG Structure of HIV-1 RT complexed with RNA/DNA hybrid in an RNA hydrolysis-off mode 提交 2017-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
168–607（440 aa）
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未记录 | EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Sodium citrate pH 5.2, CaCl2, PEG400
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.224 |
| 6BSH Structure of HIV-1 RT complexed with RNA/DNA hybrid in the RNA hydrolysis mode 提交 2017-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
168–607（440 aa）
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未记录 | EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Sodium citrate pH 5.2, CaCl2, PEG400
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分辨率 2.65 Å R-free 0.227 |
| 6BSI Structure of HIV-1 RT complexed with an RNA/DNA hybrid containing the polypurine-tract sequence 提交 2017-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
168–607（440 aa）
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未记录 | EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Sodium citrate pH 5.2, CaCl2, PEG400
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分辨率 3.25 Å R-free 0.241 |
| 6BSJ Structure of HIV-1 RT complexed with an RNA/DNA hybrid sequence non-preferred for RNA hydrolysis 提交 2017-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
168–607（440 aa）
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未记录 | EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Sodium citrate pH 5.2, CaCl2, PEG400
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分辨率 2.89 Å R-free 0.251 |
| 6VUG Diabody bound to a Reverse Transcriptase Aptamer Complex 提交 2020-02-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 B
168–595（428 aa）
片段：P51 subunit, residues 168-595
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M Ammonium Sulfate
0.1 M HEPES pH 7.8
0.1 M NaCl
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分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |