当前蛋白身份:A0A0F7R5U8 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6AWN X-ray structure of the S439T human serotonin transporter complexed with paroxetine at the central site 提交 2017-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 122–239(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 8PR Paroxetine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 40 mM Li2S04, 40 mM Na2S04, 34.5% PEG 400, 0.5% 6-aminohexanoic acid
分辨率 3.62 Å R-free 0.263
6AWO X-ray structure of the ts3 human serotonin transporter complexed with sertraline at the central site 提交 2017-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 122–239(118 aa)
未记录 SRE (1S,4S)-4-(3,4-dichlorophenyl)-N-methyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-amine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;50 mM Tris-HCl pH 8.5, 75 mM Li2SO4, 75 mM Na2SO4, 35% PEG 400, 0.5% 6-aminohexanoic acid
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6AWP X-ray structure of the ts3 human serotonin transporter complexed with fluvoxamine at the central site 提交 2017-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 122–239(118 aa)
未记录 FVX Fluvoxamine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;50 mM Tris-HCl pH 8.5, 75 mM Li2SO4, 75 mM Na2SO4, 34% PEG 400, 0.5% 6-aminohexanoic acid
分辨率 3.80 Å R-free 0.269
6AWQ Anomalous chloride signal reveals the position of sertraline complexed with the serotonin transporter at the central site 提交 2017-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 122–239(118 aa)
未记录 SRE (1S,4S)-4-(3,4-dichlorophenyl)-N-methyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-amine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;50 mM Tris-HCl pH 8.5, 40 mM Li2SO4, 40 mM Na2SO4, 35% PEG 400, 0.5% 6-aminohexanoic acid
分辨率 4.05 Å R-free 0.316
6C5H S25-5 Fab in complex with Chlamydiaceae-specific LPS antigen 提交 2018-01-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 122–239(118 aa)
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;0.1 M BIS-Tris HCl 25% [w/v] polyethylene glycol [PEG] 3350
分辨率 1.99 Å R-free 0.226
6C5I Unliganded S25-5 Fab 提交 2018-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 122–239(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;289.15 K;0.01 M NiCl2, 0.1 M Tris-HCl, 20% [w/v] PEG 2000 MME
分辨率 1.89 Å R-free 0.231
6C5J S25-23 Fab in complex with Chlamydiaceae LPS (Crystal form 1) 提交 2018-01-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 122–239(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;0.1 M MES, 20% [w/v] polyethylene glycol [PEG] 10000
分辨率 2.29 Å R-free 0.239
6C5K S25-23 Fab in complex with Chlamydiaceae LPS (Crystal form 2) 提交 2018-01-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 122–239(118 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.2 M Potassium nitrate, 20% [w/v] polyethylene glycol 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
6C5K S25-23 Fab in complex with Chlamydiaceae LPS (Crystal form 2) 提交 2018-01-16 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 122–239(118 aa)
未记录 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.2 M Potassium nitrate, 20% [w/v] polyethylene glycol 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.218