当前蛋白身份:A0A0N8ETI8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致 |
链 LR
1–203(203 aa)
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |
| 7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致 |
链 LR
1–203(203 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |
| 8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 86 PDB 声明:92-meric(92) 与全部聚合物一致 |
链 BO
1–203(203 aa)
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未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
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分辨率 3.50 Å |
| 8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致 |
链 BO
1–203(203 aa)
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未记录 | N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.90 Å |
| 8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 O
1–203(203 aa)
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.79 Å |