当前蛋白身份:A0A0N8ETI8 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 LR 1–203(203 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 LR 1–203(203 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 86 PDB 声明:92-meric(92) 与全部聚合物一致
链 BO 1–203(203 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 BO 1–203(203 aa)
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 O 1–203(203 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å