当前蛋白身份:A0A0U5BC76 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5IKC X-RAY STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN DOUBLECORTIN in complex with FAB 提交 2016-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 22–233(212 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;unknown
分辨率 2.06 Å R-free 0.265
5IKC X-RAY STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN DOUBLECORTIN in complex with FAB 提交 2016-03-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 L 22–233(212 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;unknown
分辨率 2.06 Å R-free 0.265
5VLP PCSK9 complex with LDLR antagonist peptide and Fab7G7 提交 2017-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 L 127–234(108 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;292 K;ammonium acetate, 1,8diaminooctane
分辨率 2.90 Å R-free 0.209
6U2F PCSK9-Fab 7G7 complex bound to cis-1-amino-4-phenylcyclohexaneacyl-WNLK(hR)IGLLR - NH2 提交 2019-08-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 L 127–234(108 aa) 片段:Fab
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;291 K;4 M ammonium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 3% v/v 1,8 diaminooctane
分辨率 2.94 Å R-free 0.209
6U3I Design of organo-peptides as bipartite PCSK9 antagonists 提交 2019-08-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 L 127–234(108 aa) 片段:Fab
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;291 K;4 M ammonium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 3% v/v 1,8 diaminooctane
分辨率 2.90 Å R-free 0.217
6VRH Cryo-EM structure of the wild-type human serotonin transporter complexed with paroxetine and 8B6 Fab 提交 2020-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 117–234(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 8PR Paroxetine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6VRK Cryo-EM structure of the wild-type human serotonin transporter complexed with Br-paroxetine and 8B6 Fab 提交 2020-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 117–234(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 RFS Br-paroxetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6VRL Cryo-EM structure of the wild-type human serotonin transporter complexed with I-paroxetine and 8B6 Fab 提交 2020-02-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 117–234(118 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 RFY I-paroxetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å