当前蛋白身份:A0A140NCD0 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5Z0R Structural insight into the Zika virus capsid encapsulating the viral genome 提交 2017-12-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 27–395(369 aa)
链 B 27–395(369 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 8.5;293 K;10% v/v 2-Propanol, 0.1 M BICINE pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 1500
分辨率 2.05 Å R-free 0.254
5Z0V Structural insight into the Zika virus capsid encapsulating the viral genome 提交 2017-12-21 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 27–395(369 aa)
链 D 27–395(369 aa)
突变:N293D 突变:N293D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 4.6;293 K;0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 8% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.91 Å R-free 0.248
5Z0V Structural insight into the Zika virus capsid encapsulating the viral genome 提交 2017-12-21 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 27–395(369 aa)
链 C 27–395(369 aa)
突变:N293D 突变:N293D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 4.6;293 K;0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 8% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 2.91 Å R-free 0.248
7CY4 Crystal Structure of CMD1 in apo form 提交 2020-09-03 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 27–392(366 aa)
突变:D108A, K109A, E198A,N199A,E385A,K388A,D389A FE FE (III) ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;290 K;2% (v/v) tacsimate, pH 5.0, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 16% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.223
7VNP Structure of human KCNQ4-ML213 complex with PIP2 提交 2021-10-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 26–392(367 aa)
链 C 26–392(367 aa)
链 E 26–392(367 aa)
链 G 26–392(367 aa)
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 8 K POTASSIUM ION × 4 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7VNQ Structure of human KCNQ4-ML213 complex in nanodisc 提交 2021-10-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 26–392(367 aa)
链 C 26–392(367 aa)
链 E 26–392(367 aa)
链 G 26–392(367 aa)
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
7VNR Structure of human KCNQ4-ML213 complex in digitonin 提交 2021-10-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 26–392(367 aa)
链 C 26–392(367 aa)
链 E 26–392(367 aa)
链 G 26–392(367 aa)
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å