当前蛋白身份：A0A160JCU6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5MFX Zika NS3 helicase:RNA complex 提交 2016-11-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1685–2125（441 aa）
片段：UNP residues 1685-2125
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未记录 | ACT ACETATE ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% (w/v) ethylene glycol, 10% (w/v) polyethylene glycol 8000, 0.1 M MES/Imidazole pH 6.5, 20mM sodium formate, 20mM ammonium acetate, 20mM tri-sodium citrate, 20mM sodium potassium L-tartrate.
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分辨率 1.60 Å R-free 0.191 |
| 5TFN CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZIKA VIRUS NS2B-NS3 PROTEASE in super-open conformation 提交 2016-09-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1420–1466（47 aa）
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突变：S135A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.6 mM protein, in 100 mM NaCl, 1.0 mM TCEP, 20 mM Tris-Cl buffer (pH 8.0) was mixed with the well solution (25% PEG3330, 200 mM NaCl and 100 mM BisTris pH 6.5)
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分辨率 3.00 Å R-free 0.259 |
| 5TFN CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZIKA VIRUS NS2B-NS3 PROTEASE in super-open conformation 提交 2016-09-26 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1420–1466（47 aa）
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突变：S135A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.6 mM protein, in 100 mM NaCl, 1.0 mM TCEP, 20 mM Tris-Cl buffer (pH 8.0) was mixed with the well solution (25% PEG3330, 200 mM NaCl and 100 mM BisTris pH 6.5)
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分辨率 3.00 Å R-free 0.259 |
| 5TFN CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZIKA VIRUS NS2B-NS3 PROTEASE in super-open conformation 提交 2016-09-26 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1420–1466（47 aa）
链 B
1420–1466（47 aa）
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突变：S135A 突变：S135A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.6 mM protein, in 100 mM NaCl, 1.0 mM TCEP, 20 mM Tris-Cl buffer (pH 8.0) was mixed with the well solution (25% PEG3330, 200 mM NaCl and 100 mM BisTris pH 6.5)
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分辨率 3.00 Å R-free 0.259 |
| 6RWZ Structure of Zika virus NS3 helicase in complex with ADP-BeF3 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1685–2125（441 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；20% w/v glycerol, 10% w/v polyethylene glycol 4000, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 20 mM sodium formate, 20 mM ammonium acetate, 20 mM trisodium citrate, and 20 mM sodium potassium L-tartrate.
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分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 6S0J Structure of Zika virus NS3 helicase in complex with ADP-MgF3(H2O)- 提交 2019-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1685–2125（441 aa）
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未记录 | KQB trifluoromagnesate monohydrate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；15% PEG3350, 0.16 M sodium citrate and 9% ethylene glycol
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分辨率 1.50 Å R-free 0.189 |