当前蛋白身份:A0A1B8Y854 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8EUE Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 D 5–126(122 aa)
链 H 5–126(122 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUJ Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 D 5–126(122 aa)
链 H 5–126(122 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.36 Å
9E3R Cryo-EM structure of PWWP domain deleted DNMT 3A2/3B3 in complex with a di-nucleosome 提交 2024-10-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:26-meric(26) 与全部聚合物一致
链 D 5–126(122 aa)
链 H 5–126(122 aa)
链 P 5–126(122 aa)
链 T 5–126(122 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
9E3U Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer bound to a di-nucleosome with a 25 base-pair linker 提交 2024-10-24 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:15-meric(15) 与全部聚合物一致
链 D 5–126(122 aa)
链 H 5–126(122 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
9E49 Cryo-EM structure of a di-nucleosome with an eight base-pair linker 提交 2024-10-24 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 D 5–126(122 aa)
链 H 5–126(122 aa)
链 P 5–126(122 aa)
链 T 5–126(122 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.93 Å