当前蛋白身份：A0A1X8XLE9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6W9K Structure of the Ancestral Glucocorticoid Receptor 2 ligand binding domain in complex with Prednisolone and PGC1a coregulator fragment 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–248（248 aa）
|
未记录 | TUA prednisolone × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M ammonium acetate, 3.0 M sodium formate, and 0.1 M HEPES 8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.192 |
| 6W9L Structure of the Ancestral Glucocorticoid Receptor 2 ligand binding domain in complex with deacetylated deflazacort and PGC1a coregulator fragment 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | TUS (4aR,4bS,5S,6aS,6bS,9aR,10aS,10bS)-5-hydroxy-6b-(hydroxyacetyl)-4a,6a,8-trimethyl-4a,4b,5,6,6a,6b,9a,10,10a,10b,11,12-dodecahydro-2H-naphtho[2',1':4,5]indeno[1,2-d][1,3]oxazol-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M ammonium acetate, 2.5 M sodium formate, and 0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.200 |
| 6W9M Structure of the Ancestral Glucocorticoid Receptor 2 ligand binding domain in complex with vamorolone and SHP coregulator fragment 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | TUV vamorolone × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；289.15 K；25% PEG 300 and 0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.220 |
| 7YXC Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CO3 CARBONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；85 mM sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 0.17 M sodium acetate trihydrate, 25.5% (w/v) PEG8000, 15% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.245 |
| 7YXD Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 7YXD Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 7YXD Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 7YXD Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-15 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 7YXN Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M PIPES, pH 7.0, 0.1 M ammonium acetate, 2.5 M sodium formate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.247 |
| 7YXN Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M PIPES, pH 7.0, 0.1 M ammonium acetate, 2.5 M sodium formate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.247 |
| 7YXO Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 CPS 3-[(3-CHOLAMIDOPROPYL)DIMETHYLAMMONIO]-1-PROPANESULFONATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.280 |
| 7YXO Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 CPS 3-[(3-CHOLAMIDOPROPYL)DIMETHYLAMMONIO]-1-PROPANESULFONATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.280 |
| 7YXO Crystal structure of WT AncGR2-LBD bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.280 |
| 7YXP Crystal structure of WT AncGR2-LBD WT bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M sodium chloride, 2.0 M ammonium sulfate
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.288 |
| 7YXR Crystal structure of mutant AncGR2-LBD (Y545A) bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M PIPES, pH 7.0, 0.1 M ammonium acetate, 2.5 M sodium formate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |
| 7YXR Crystal structure of mutant AncGR2-LBD (Y545A) bound to dexamethasone and SHP coregulator fragment 提交 2022-02-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–248（247 aa）
|
未记录 | DEX DEXAMETHASONE × 1 FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M PIPES, pH 7.0, 0.1 M ammonium acetate, 2.5 M sodium formate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.224 |