当前蛋白身份:A0A218N8A3 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1UZD Chlamydomonas,Spinach Chimeric Rubisco 提交 2004-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 1–475(475 aa)
链 B 1–475(475 aa)
链 E 1–475(475 aa)
链 H 1–475(475 aa)
链 K 1–475(475 aa)
链 O 1–475(475 aa)
链 R 1–475(475 aa)
链 V 1–475(475 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 54 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;291 K;50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
7JN4 Rubisco in the apo state 提交 2020-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 1–475(475 aa)
链 C 1–475(475 aa)
链 E 1–475(475 aa)
链 G 1–475(475 aa)
链 I 1–475(475 aa)
链 K 1–475(475 aa)
链 M 1–475(475 aa)
链 O 1–475(475 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8;200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
7JSX EPYC1(106-135) peptide-bound Rubisco 提交 2020-08-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 1–475(475 aa)
链 C 1–475(475 aa)
链 E 1–475(475 aa)
链 G 1–475(475 aa)
链 I 1–475(475 aa)
链 K 1–475(475 aa)
链 M 1–475(475 aa)
链 O 1–475(475 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8;200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.06 Å