当前蛋白身份:A0A218N8A3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1UZD Chlamydomonas,Spinach Chimeric Rubisco 提交 2004-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A
1–475(475 aa)
链 B
1–475(475 aa)
链 E
1–475(475 aa)
链 H
1–475(475 aa)
链 K
1–475(475 aa)
链 O
1–475(475 aa)
链 R
1–475(475 aa)
链 V
1–475(475 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 54 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;291 K;50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 7JN4 Rubisco in the apo state 提交 2020-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A
1–475(475 aa)
链 C
1–475(475 aa)
链 E
1–475(475 aa)
链 G
1–475(475 aa)
链 I
1–475(475 aa)
链 K
1–475(475 aa)
链 M
1–475(475 aa)
链 O
1–475(475 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.68 Å |
| 7JSX EPYC1(106-135) peptide-bound Rubisco 提交 2020-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 A
1–475(475 aa)
链 C
1–475(475 aa)
链 E
1–475(475 aa)
链 G
1–475(475 aa)
链 I
1–475(475 aa)
链 K
1–475(475 aa)
链 M
1–475(475 aa)
链 O
1–475(475 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.06 Å |