当前蛋白身份：A0A2J8VEN6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7QI4 Human mitochondrial ribosome at 2.2 A resolution (bound to partly built tRNAs and mRNA) 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
1–87（87 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 206 K POTASSIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.21 Å |
| 7QI5 Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A/A-, P/P- and E/E-tRNAs at 2.63 A resolution 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
1–87（87 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 208 K POTASSIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 7QI6 Human mitochondrial ribosome in complex with mRNA, A/P- and P/E-tRNAs at 2.98 A resolution 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
1–87（87 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 54 MG MAGNESIUM ION × 202 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 VAL VALINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9IGT Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit bound to METTL15, RBFA, and mtIF2 (State M2.1) 提交 2025-02-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 Q
2–87（86 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.96 Å |
| 9IGU Assembly intermediate of human mitochondrial ribosome small subunit bound to METTL15 and RBFA (Inward conformation) (State M2) 提交 2025-02-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 Q
2–87（86 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 31 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 9UWH human mitoribosome trapped by retapamulin 提交 2025-05-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
2–87（86 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 208 K POTASSIUM ION × 53 G34 Retapamulin × 1 VAL VALINE × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |