当前蛋白身份：A0A376KDN7
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6I4Y X-ray structure of the human mitochondrial PRELID3b-TRIAP1 complex 提交 2018-11-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
27–393（367 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；Tacsimate (60% v/v) pH 7
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.296 |
| 6QF7 Crystal structures of the recombinant beta-Factor XIIa protease with bound Thr-Arg and Pro-Arg substrate mimetics 提交 2019-01-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–393（368 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；292 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6 with 10% PEG 4000 and 0.15 M MgCl2
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.356 |
| 6QF7 Crystal structures of the recombinant beta-Factor XIIa protease with bound Thr-Arg and Pro-Arg substrate mimetics 提交 2019-01-09 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
26–393（368 aa）
|
未记录 | 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；292 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6 with 10% PEG 4000 and 0.15 M MgCl2
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.356 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 10 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 11 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 12 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 5 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 6 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 7 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 8 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6QUG GHK tagged MBP-Nup98(1-29) 提交 2019-02-27 | Assembly 9 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
27–392（366 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG550, PEG20,000, MOPS, HEPES, sodium Phosphate, sodium nitrate, ammonium sulphate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.226 |
| 6SJV Structure of HPV18 E6 oncoprotein in complex with mutant E6AP LxxLL motif 提交 2019-08-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：;K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,F1049R,L2386F,E2393R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,F1049R,L2386F,E2393R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,F1049R,L2386F,E2393R ; | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；298 K；Sodium Cacodylate 100 mM pH 6.5, PEG 8000 5%, 2-methyl-2,4-pentanediol 40%
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.242 |
| 6WBH Crystal structure of mRECK(CC4) in fusion with engineered MBP at medium resolution 提交 2020-03-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–392（364 aa）
|
突变：D84A,K85A,E174A,N175A,A217H,K221H,K241A,A314V,I319V,E361A,K364A,D365A | CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 25% PEG 4000
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.220 |
| 6WBJ High resolution crystal structure of mRECK(CC4) in fusion with engineered MBP 提交 2020-03-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–392（364 aa）
|
突变：D84A,K85A,E174A,N175A,A217H,K221H,K241A,A314V,I319V,E361A,K364A,D365A | SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 25% PEG 4000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.177 |
| 7B01 ADAMTS13-CUB12 提交 2020-11-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–387（361 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；21% (v/v) PEG1500, 100 mM Sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, 200 mM MnCl2, Bis-Tris propane, pH 5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.292 |
| 7CY5 Crystal Structure of CMD1 in complex with vitamin C 提交 2020-09-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
片段：dioxygenase,dioxygenase
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, E385A, K388A, D389A | FE FE (III) ION × 1 ASC ASCORBIC ACID × 1 CIT CITRIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.6；290 K；2% Tacsimate, 0.1M CIT pH 5.6, 16% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.221 |
| 7CY6 Crystal Structure of CMD1 in complex with 5mC-DNA 提交 2020-09-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, E385A, K388A, D389A | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 FE2 FE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；290 K；15% (v/v) 2-propanol, 0.1 M sodium citrate, pH 5.0, and 10% (w/v) PEG 10000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.227 |
| 7CY7 Crystal Structure of CMD1 in complex with DNA 提交 2020-09-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, E385A, K388A, D389A | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 FE2 FE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；290 K；15% (v/v) 2-propanol, 0.1 M sodium citrate, pH 5.0, and 10% (w/v) PEG 10000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.221 |
| 7CY8 Crystal Structure of CMD1 in complex with 5mC-DNA and vitamin C 提交 2020-09-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, E385A, K388A, D389A | ASC ASCORBIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 FE2 FE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；290 K；15% (v/v) 2-propanol, 0.1 M sodium citrate, pH 5.0, and 10% (w/v) PEG 10000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |
| 7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 K
26–392（367 aa）
链 L
26–392（367 aa）
链 M
26–392（367 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 L
26–392（367 aa）
链 M
26–392（367 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7XMN Structure of SARS-CoV-2 ORF8 提交 2022-04-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NNH NOR-N-OMEGA-HYDROXY-L-ARGININE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M MES pH6.1, 2%Polyethylene glycol 400, 2.1 M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 8CDY N-terminal domain of human apolipoprotein E 提交 2023-02-01 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；HEPES, PEG 6000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 8CE0 N-terminal domain of human apolipoprotein E 提交 2023-02-01 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
24–396（373 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；NaCl, Hepes, PEG 8000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.215 |
| 8D9X Cryo-EM structure of human DELE1 in oligomeric form 提交 2022-06-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
27–387（361 aa）
链 B
27–387（361 aa）
链 C
27–387（361 aa）
链 D
27–387（361 aa）
链 E
27–387（361 aa）
链 F
27–387（361 aa）
链 G
27–387（361 aa）
链 H
27–387（361 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8JYX Crystal structure of the gasdermin-like protein RCD-1-1 from Neurospora crassa 提交 2023-07-04 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, K265A, K388A, D389A, K174A, K175A, K176A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；0.1 M Bicine pH 7.4, 11% PEG 3350, 3% (w/v) D(+)-Glucose monohydrate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 8JYX Crystal structure of the gasdermin-like protein RCD-1-1 from Neurospora crassa 提交 2023-07-04 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, K265A, K388A, D389A, K174A, K175A, K176A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；0.1 M Bicine pH 7.4, 11% PEG 3350, 3% (w/v) D(+)-Glucose monohydrate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 L
26–387（362 aa）
链 M
26–387（362 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 L
26–387（362 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |