当前蛋白身份:A0A5F9C3C5 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 C2 15–439(425 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 C 15–439(425 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 C 15–439(425 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 C 15–439(425 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 C 15–439(425 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å