当前蛋白身份:A0A6A5PYM2
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6XIQ Cryo-EM Structure of K63R Ubiquitin Mutant Ribosome under Oxidative Stress 提交 2020-06-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 J
1–174(174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XIR Cryo-EM Structure of K63 Ubiquitinated Yeast Translocating Ribosome under Oxidative Stress 提交 2020-06-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致 |
链 J
1–174(174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7RR5 Structure of ribosomal complex bound with Rbg1/Tma46 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致 |
链 LJ
1–174(174 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 286 ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 7ZPQ Structure of the RQT-bound 80S ribosome from S. cerevisiae (C1) 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 BJ
6–174(169 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 86 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 7ZRS Structure of the RQT-bound 80S ribosome from S. cerevisiae (C2) - composite map 提交 2022-05-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 BJ
6–174(169 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7ZUW Structure of RQT (C1) bound to the stalled ribosome in a disome unit from S. cerevisiae 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致 |
链 BJ
6–174(169 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 86 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8BN3 Yeast 80S, ES7s delta, eIF5A, Stm1 containing 提交 2022-11-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:81-meric(81) 与全部聚合物一致 |
链 M1
6–173(168 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 K POTASSIUM ION × 72 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 SPD SPERMIDINE × 3 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8BQD Yeast 80S ribosome in complex with Map1 (conformation 1) 提交 2022-11-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:80-meric(80) 与全部聚合物一致 |
链 AG
6–174(169 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8BQX Yeast 80S ribosome in complex with Map1 (conformation 2) 提交 2022-11-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:80-meric(80) 与全部聚合物一致 |
链 AG
6–174(169 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |