当前蛋白身份:A0A6A5Q1H1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6XIQ Cryo-EM Structure of K63R Ubiquitin Mutant Ribosome under Oxidative Stress 提交 2020-06-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 y 1–200(200 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6XIR Cryo-EM Structure of K63 Ubiquitinated Yeast Translocating Ribosome under Oxidative Stress 提交 2020-06-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 y 1–200(200 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7OSA Pre-translocation complex of 80 S.cerevisiae ribosome with eEF2 and ligands 提交 2021-06-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 eS8 1–200(200 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 490 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG10K, KSCN, TRIS-HAC
分辨率 3.00 Å R-free 0.250
7OSM Intermediate translocation complex of 80 S.cerevisiae ribosome with eEF2 and ligands 提交 2021-06-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 eS8 1–200(200 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 499 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 6000, KSCN, Tris-HAc
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
7RR5 Structure of ribosomal complex bound with Rbg1/Tma46 提交 2021-08-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 SI 1–200(200 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 286 ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
7ZPQ Structure of the RQT-bound 80S ribosome from S. cerevisiae (C1) 提交 2022-04-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 AI 1–200(200 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 86 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
8UTI Eukaryotic 80S ribosome with Reh1 and A/P site tRNA 提交 2023-10-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 SV 2–199(198 aa)
未记录 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å