当前蛋白身份:A0A6A5Q1K4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7ON1 Cenp-A nucleosome in complex with Cenp-C 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 c
1–132(132 aa)
链 g
1–132(132 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9B1E Cryo-EM structure of native SWR1 bound to nucleosome (composite structure) 提交 2024-03-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–132(132 aa)
链 S
1–132(132 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;80 nM SWR1, 160 nM nucleosomes, 1 mM ADP, 10 mM NaF, 8 mM BeCl2, 0.05% glutaraldehyde, 20 mM HEPES-KOH pH 7.6, 1.5 mM MgCl2, 0.25 mM TCEP, 0.01% IGEPAL CA-630, 1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 second blot time and blot force of 10.
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分辨率 4.40 Å |
| 9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:20-meric(20) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–132(132 aa)
链 G
1–132(132 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 OTHER
|
分辨率 3.09 Å |