当前蛋白身份：A0A6A5Q627
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6XIQ Cryo-EM Structure of K63R Ubiquitin Mutant Ribosome under Oxidative Stress 提交 2020-06-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–387（387 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6XIR Cryo-EM Structure of K63 Ubiquitinated Yeast Translocating Ribosome under Oxidative Stress 提交 2020-06-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 70 PDB 声明：76-meric（76） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–387（387 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7OSA Pre-translocation complex of 80 S.cerevisiae ribosome with eEF2 and ligands 提交 2021-06-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致 |
链 uL3
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 490 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG10K, KSCN, TRIS-HAC
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 7OSM Intermediate translocation complex of 80 S.cerevisiae ribosome with eEF2 and ligands 提交 2021-06-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致 |
链 uL3
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 499 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 6000, KSCN, Tris-HAc
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.284 |
| 7RR5 Structure of ribosomal complex bound with Rbg1/Tma46 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric（87） 与全部聚合物一致 |
链 LB
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 286 ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 7TOO Yeast 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 AL03
1–387（387 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7TOP Yeast 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein PR20 提交 2022-01-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 AL03
1–387（387 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 7ZPQ Structure of the RQT-bound 80S ribosome from S. cerevisiae (C1) 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 BB
2–387（386 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 86 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 7ZRS Structure of the RQT-bound 80S ribosome from S. cerevisiae (C2) - composite map 提交 2022-05-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 BB
2–387（386 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7ZUW Structure of RQT (C1) bound to the stalled ribosome in a disome unit from S. cerevisiae 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 BB
2–387（386 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 86 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8AAF Yeast RQC complex in state G 提交 2022-07-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8AGU Yeast RQC complex in state E 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8AGV Yeast RQC complex in state H 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8AGW Yeast RQC complex in state D 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8AGZ Yeast RQC complex in state with the RING domain of Ltn1 in the OUT position 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–387（387 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 7 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8BN3 Yeast 80S, ES7s delta, eIF5A, Stm1 containing 提交 2022-11-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：81-meric（81） 与全部聚合物一致 |
链 L3
2–387（386 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 K POTASSIUM ION × 72 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 SPD SPERMIDINE × 3 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8BQD Yeast 80S ribosome in complex with Map1 (conformation 1) 提交 2022-11-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：80-meric（80） 与全部聚合物一致 |
链 BA
2–387（386 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8UT0 Eukaryotic 80S ribosome with Reh1, eIF5A and A/P site tRNA 提交 2023-10-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致 |
链 LE
2–387（386 aa）
|
未记录 | 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 8UTI Eukaryotic 80S ribosome with Reh1 and A/P site tRNA 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 LE
2–387（386 aa）
|
未记录 | 3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |