当前蛋白身份:A0A829A8C6 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7QGN Structure of the SmrB-bound E. coli disome - stalled 70S ribosome 提交 2021-12-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 J 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
7QGR Structure of the SmrB-bound E. coli disome - collided 70S ribosome 提交 2021-12-09 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 H 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
7S1I Wild-type Escherichia coli stalled ribosome with antibiotic radezolid 提交 2021-09-02 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致
链 y 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 209 RD8 Radezolid × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
7S1J Wild-type Escherichia coli ribosome with antibiotic radezolid 提交 2021-09-02 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 y 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 199 RD8 Radezolid × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.47 Å
7S1K Cfr-modified Escherichia coli stalled ribosome with antibiotic radezolid 提交 2021-09-02 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致
链 y 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 207 RD8 Radezolid × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
7UG7 70S ribosome complex in an intermediate state of translocation bound to EF-G(GDP) stalled by Argyrin B 提交 2022-03-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致
链 SQ 1–84(84 aa)
未记录 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 11 MG MAGNESIUM ION × 404 SPD SPERMIDINE × 2 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.58 Å
8EIU E. coli 70S ribosome with A-loop mutations U2554C and U2555C 提交 2022-09-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致
链 Q 1–84(84 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 268 SPD SPERMIDINE × 16 8AN 3'-amino-3'-deoxyadenosine 5'-(dihydrogen phosphate) × 2 SPM SPERMINE × 1 MET METHIONINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.24 Å
8EMM Composite 70S ribosome structure for "Atomistic simulations of the E. coli ribosome provide selection criteria for translationally active substrates 提交 2022-09-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致
链 Q 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 321 SPD SPERMIDINE × 17 SPM SPERMINE × 1 K POTASSIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 2 MET METHIONINE × 2 PAR PAROMOMYCIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8EYQ 30S_delta_ksgA_h44_inactive_conformation 提交 2022-10-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 Q 1–84(84 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8FIZ Cryo-EM structure of E. coli 70S Ribosome containing mRNA and tRNA (in the transcription-translation complex) 提交 2022-12-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 AS 1–84(84 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8FTO E. coli 70S ribosome with an improved MS2 tag inserted in H98 提交 2023-01-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 Q 1–84(84 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 284 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.85 Å