当前蛋白身份:A0A829A8C6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7QGN Structure of the SmrB-bound E. coli disome - stalled 70S ribosome 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致 |
链 J
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 7QGR Structure of the SmrB-bound E. coli disome - collided 70S ribosome 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 H
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 7S1I Wild-type Escherichia coli stalled ribosome with antibiotic radezolid 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 y
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 209 RD8 Radezolid × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å |
| 7S1J Wild-type Escherichia coli ribosome with antibiotic radezolid 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致 |
链 y
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 199 RD8 Radezolid × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å |
| 7S1K Cfr-modified Escherichia coli stalled ribosome with antibiotic radezolid 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 y
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 207 RD8 Radezolid × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 7UG7 70S ribosome complex in an intermediate state of translocation bound to EF-G(GDP) stalled by Argyrin B 提交 2022-03-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 SQ
1–84(84 aa)
|
未记录 | PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 11 MG MAGNESIUM ION × 404 SPD SPERMIDINE × 2 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 8EIU E. coli 70S ribosome with A-loop mutations U2554C and U2555C 提交 2022-09-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–84(84 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 268 SPD SPERMIDINE × 16 8AN 3'-amino-3'-deoxyadenosine 5'-(dihydrogen phosphate) × 2 SPM SPERMINE × 1 MET METHIONINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.24 Å |
| 8EMM Composite 70S ribosome structure for "Atomistic simulations of the E. coli ribosome provide selection criteria for translationally active substrates 提交 2022-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 321 SPD SPERMIDINE × 17 SPM SPERMINE × 1 K POTASSIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 2 MET METHIONINE × 2 PAR PAROMOMYCIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
| 8EYQ 30S_delta_ksgA_h44_inactive_conformation 提交 2022-10-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–84(84 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8FIZ Cryo-EM structure of E. coli 70S Ribosome containing mRNA and tRNA (in the transcription-translation complex) 提交 2022-12-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 AS
1–84(84 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8FTO E. coli 70S ribosome with an improved MS2 tag inserted in H98 提交 2023-01-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–84(84 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 284 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.85 Å |