当前蛋白身份:A0A8X6EH11 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7PLA Cryo-EM structure of ShCas12k in complex with a sgRNA and a dsDNA target 提交 2021-08-30 Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–641(641 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8BD5 Cas12k-sgRNA-dsDNA-S15-TniQ-TnsC transposon recruitment complex 提交 2022-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 A 1–641(641 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8RDU Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K composite map 提交 2023-12-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 A 4–641(638 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8RKT Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K Cas12k domain local-refinement map 提交 2023-12-30 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 A 4–641(638 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.35 Å