当前蛋白身份：A0A9X9ZA84
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8V65 Nanorana parkeri saxiphilin:dcGTX2 (co-crystal) 提交 2023-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 YGU (3aS,4R,7R,9R,10aS)-2,6-diamino-10,10-dihydroxy-4-(hydroxymethyl)-3a,4,9,10-tetrahydro-1H,8H-pyrrolo[1,2-c]purin-9-yl hydrogen sulfate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, dcGTX2&3:NpSxph molar ratio 1.2:1
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 8V66 Nanorana parkeri saxiphilin:GTX5 (co-crystal) 提交 2023-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
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未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 YGZ ({[(3aS,4R,7S,10aS)-2,6-diamino-10,10-dihydroxy-3a,4,9,10-tetrahydro-1H,8H-pyrrolo[1,2-c]purin-4-yl]methoxy}carbonyl)sulfamic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, GTX5:NpSxph molar ratio 1.2:1
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.218 |
| 8V67 Nanorana parkeri saxiphilin:C1 (co-crystal) 提交 2023-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
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未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 YH9 ({[(3aS,4R,7R,9R,10aS)-2,6-diamino-10,10-dihydroxy-9-(sulfooxy)-3a,4,9,10-tetrahydro-1H,8H-pyrrolo[1,2-c]purin-4-yl]methoxy}carbonyl)sulfamic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, C1&C2:NpSxph molar ratio 1.2:1
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分辨率 1.90 Å R-free 0.229 |
| 8V68 Nanorana parkeri saxiphilin:dcSTX (co-crystal) 提交 2023-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
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未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 YGF (3aS,4R,7R,10aS)-2,6-diamino-4-(hydroxymethyl)-3a,4,8,9-tetrahydro-1H,10H-pyrrolo[1,2-c]purine-10,10-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, dcSTX:NpSxph molar ratio 1.2:1
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.225 |
| 8V69 Nanorana parkeri saxiphilin:GTX2 (co-crystal) 提交 2023-12-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
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未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 YGQ Gonyautoxin II × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, GTX2&3:NpSxph molar ratio 1.2:1
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分辨率 1.95 Å R-free 0.212 |
| 9Y91 Nanorana parkeri saxiphilin:STX-C13-NBz (co-crystal) 提交 2025-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
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未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 A1CTW N-{[(2Z,3aS,4S,6Z,7R,10aS)-10,10-dihydroxy-2,6-diiminooctahydro-1H,8H-pyrrolo[1,2-c]purin-4-yl]methyl}benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, STX-C13-NBz:NpSxph molar ratio 1.2:1
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分辨率 1.95 Å R-free 0.223 |
| 9Y92 Nanorana parkeri saxiphilin:STX-C13-OBz (co-crystal) 提交 2025-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–854（854 aa）
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未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 A1CTG [(2Z,3aS,4R,6Z,7R,10aS)-10,10-dihydroxy-2,6-diiminooctahydro-1H,8H-pyrrolo[1,2-c]purin-4-yl]methyl benzoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277.15 K；20-25% v/v PEG400, 4-5% w/v PGA-LM, 100-200 mM sodium acetate, pH 5.0, STX-C13-OBz:NpSxph molar ratio 1.2:1
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分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |