当前蛋白身份：A1AGK1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8G6Y Structure of WT E.coli ribosome 50S subunit with complexed with mRNA, P-site fMet-NH-tRNAfMet and A-site 3-aminopyridine-4-carboxylic acid charged NH-tRNAPhe 提交 2023-02-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 YRW 3-aminopyridine-4-carboxamide × 1 8AN 3'-amino-3'-deoxyadenosine 5'-(dihydrogen phosphate) × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 231 K POTASSIUM ION × 15 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.09 Å |
| 9AX7 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + CUG start codon) 提交 2024-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9CG5 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + UUG start codon) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9CG6 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + GUG start codon) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9CG7 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + AUG start codon) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9O2Y Structure of WT E.coli ribosome 70S subunit with complexed with mRNA, P-site fMet-NH-tRNAfMet and A-site (R) beta-2-hydroxy-BocLysine acid charged NH-tRNAPyl 提交 2025-04-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 320 SPD SPERMIDINE × 13 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 SPM SPERMINE × 1 K POTASSIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 2 A1B70 (2R)-6-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-2-(hydroxymethyl)hexanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.14 Å |