当前蛋白身份：A2NHM3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ZEA Structure of the anti-cholera toxin antibody Fab fragment TE33 in complex with a D-peptide 提交 2005-04-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–216（216 aa）
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未记录 | CIT CITRIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；PEG 8000, citrat buffer, potassium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.248 |
| 2DTM Thermodynamic and structural analyses of hydrolytic mechanism by catalytic antibodies 提交 2006-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
片段：FAB FRAGMENT
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293 K；50mM Tris-HCl(pH 8.7), 16%(w/v) PEG4000, 0.1mM EDTA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.278 |
| 2IPT PFA1 Fab Fragment 提交 2006-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
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未记录 | ACM ACETAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；0.1 M Hepes, 25% PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 2IQA PFA2 FAB fragment, monoclinic apo form 提交 2006-10-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
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未记录 | ACM ACETAMIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；0.1 M Bis-Tris, 28% PEG-MME 2000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION
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分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 2IQA PFA2 FAB fragment, monoclinic apo form 提交 2006-10-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–219（219 aa）
|
未记录 | ACM ACETAMIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；0.1 M Bis-Tris, 28% PEG-MME 2000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 2R0W PFA2 FAB complexed with Abeta1-8 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
片段：light chain
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.3；295 K；25% PEG-MME 5000, 0.1 M OAc, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 2R0Z PFA1 FAB complexed with GripI peptide fragment 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
片段：light chain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；295 K；PEG, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.261 |
| 3EYS PFA1 Fab fragment complexed with pyro-Glu3-A-Beta (3-8) 提交 2008-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% w/v PEG2000-MME, pH 8.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.256 |
| 3EYU PFA1 Fab fragment complexed with Ror2(518-525) 提交 2008-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–219（219 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M LiCl, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.248 |
| 4P3D MT1-MMP:Fab complex (Form II) 提交 2014-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–217（217 aa）
链 L
1–217（217 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl.hexahydrate, 0.1M Hepes
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分辨率 1.95 Å R-free 0.210 |
| 4TPR Structure of Tau5 antibody Fab fragment 提交 2014-06-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：Dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–218（218 aa）
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 CL CHLORIDE ION × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 33O 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36-dodecaoxaoctatriacontane-1,38-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris, 25 % w/v PEG 3350
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分辨率 1.60 Å R-free 0.191 |
| 4TQE Structure of tau peptide in complex with Tau5 antibody Fab fragment 提交 2014-06-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–218（218 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 NA SODIUM ION × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M lithium sulphate, 30% PEG 4000, 0.1M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.197 |
| 6PXR Anti-TAU BIIB092 FAB with TAU peptide 提交 2019-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
103–219（117 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 20% w/v PEG2000 MME, 200 mM trimethylamine N-oxide, 100 mM non-detergent sulfobetaine 201
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.268 |
| 7A6C Nanodisc reconstituted human ABCB1 in complex with MRK16 Fab and elacridar 提交 2020-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–219（219 aa）
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未记录 | R0Z elacridar × 2 CLR CHOLESTEROL × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |