当前蛋白身份：A2NTY6
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2E7L Structure of a high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2007-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
30–144（115 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-144
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.246 |
| 2E7L Structure of a high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9 提交 2007-01-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
30–144（115 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-144
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M ammonium phosphate, 20% PEG 3350, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.246 |
| 2OI9 Structure of the 2C/Ld/QL9 allogeneic complex 提交 2007-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
30–144（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；0.9M sodium dihydrogen phosphate, 0.01M di-potassium hydrogen phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.226 |
| 2PXY Crystal structures of immune receptor complexes 提交 2007-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
32–144（113 aa）
|
突变：G17E,H47Y,I75T,L78S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M succinic acid (pH7.0), 16% polyethylene glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.253 |
| 2Z31 Crystal structure of immune receptor complex 提交 2007-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
32–144（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2M patassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M succinic acid, 16% polyethylene glycol 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 2Z35 Crystal structure of immune receptor 提交 2007-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
32–144（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.8M mono-sodium dihydrogen phosphate, 0.8M mono-potassium dihydrogen phosphate and 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.285 |
| 3MC0 Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a Mouse T-cell Receptor beta Chain 提交 2010-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
31–144（114 aa）
片段：unp residues 31-144
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；sodium acetate 1.4 M
protein concentration 7.5 mg/ml, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.211 |
| 3MC0 Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a Mouse T-cell Receptor beta Chain 提交 2010-03-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
31–144（114 aa）
片段：unp residues 31-144
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；sodium acetate 1.4 M
protein concentration 7.5 mg/ml, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.211 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 3OWE Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin G (SEG) in Complex with a High Affinity Mutant Mouse T-cell Receptor Chain 提交 2010-09-17 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
29–144（116 aa）
片段：VARIABLE DOMAIN
|
突变：G17E, A52V, S54N, K66E, Q72H, E80V, L81S, T87S, G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.2 M sodium citrate, 30% iso-propanol and 0.1 M sodium cacodylate, Protein concentration: 3.25 mg/ml in the drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.261 |
| 6MIV Crystal structure of the mCD1d/xxq (JJ300)/iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JU1 N-[(2S,3S,4R)-1-({4-O-[(4-tert-butylphenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.219 |
| 6MIY Crystal structure of the mCD1d/xxa (JJ239)/iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 JTV N-{(2S,3S,4R)-1-[(4-O-benzyl-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 m ammonium tartrate dibasic, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.247 |
| 6MIY Crystal structure of the mCD1d/xxa (JJ239)/iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
29–123（95 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 JTV N-{(2S,3S,4R)-1-[(4-O-benzyl-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 m ammonium tartrate dibasic, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.247 |
| 6MJ4 Crystal structure of MCD1D/INKTCR TERNARY COMPLEX bound to glycolipid (XXW) 提交 2018-09-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTG N-[(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-{[4-O-(prop-2-en-1-yl)-alpha-D-galactopyranosyl]oxy}octadecan-2-yl]hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 6MJ6 Crystal structure of the mCD1d/xxx (JJ166) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 7 NA SODIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTM N-[(2S,3S,4R)-1-({4-O-[(4-chlorophenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.234 |
| 6MJA Crystal structure of the mCD1d/xxo (JJ294) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTJ N-[(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-({4-O-[(4-methylphenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)octadecan-2-yl]hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 m ammonium tartrate dibasic, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.237 |
| 6MJI Crystal structure of the mCD1d/xxs (JJ304) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JTD N-[(2S,3S,4R)-1-{[4-O-(cyclopropylmethyl)-alpha-D-galactopyranosyl]oxy}-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 6MJJ Crystal structure of the mCD1d/xxm (JJ290) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 NA SODIUM ION × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JU4 N-[(2S,3S,4R)-1-({4-O-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-alpha-D-galactopyranosyl}oxy)-3,4-dihydroxyoctadecan-2-yl]hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.216 |
| 6MJQ Crystal structure of the mCD1d/xxp (JJ295) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 JUD N-{(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-[(4-O-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]octadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.258 |
| 6MJQ Crystal structure of the mCD1d/xxp (JJ295) /iNKTCR ternary complex 提交 2018-09-21 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
29–123（95 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 JUD N-{(2S,3S,4R)-3,4-dihydroxy-1-[(4-O-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-alpha-D-galactopyranosyl)oxy]octadecan-2-yl}hexacosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 m sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.258 |
| 8T4Z T-cell receptor and lipid complex structure 提交 2023-06-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
29–123（95 aa）
|
未记录 | Y73 N-[(2R,3R,4E)-1,3-dihydroxyoctadec-4-en-2-yl]tetracosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；18-20% PEG3350, 8% Tacsimate pH 5.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.265 |