当前蛋白身份:A3F718 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3DTX Crystal structure of HLA-B*2705 complexed with the double citrullinated vasoactive intestinal peptide type 1 receptor (VIPR) peptide (residues 400-408) 提交 2008-07-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa) 片段:EXTRACELLUAR DOMAIN, RESIDUES 25-300
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;0.1M TRIS HCL, 25% PEG 8000,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
3DTX Crystal structure of HLA-B*2705 complexed with the double citrullinated vasoactive intestinal peptide type 1 receptor (VIPR) peptide (residues 400-408) 提交 2008-07-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa) 片段:EXTRACELLUAR DOMAIN, RESIDUES 25-300
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;0.1M TRIS HCL, 25% PEG 8000,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
6Y26 Crystal structure of HLA-B2705 complexed with the nona-peptide mA 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.20 Å R-free 0.174
6Y28 Crystal structure of HLA-B2705 complexed with the nona-peptide mE 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.69 Å R-free 0.236
6Y2A Crystal structure of HLA-B2705 complexed with the nona-peptide mQ 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;20% (w/v) PEG8000, 150 mM NaCl and 100 mM Tris-HCl, pH 7.0
分辨率 1.25 Å R-free 0.155
7CIQ Phosphorylation modification of MHC I polypeptide 提交 2020-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;0.2MSodiumchloride,0.1MBis-Tris(pH6.5),25%(w/v)PEG 3,350
分辨率 1.59 Å R-free 0.209
7CIR Peptide phosphorylation modification of MHC class I molecules 提交 2020-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;0.1M TRIS-HCl (PH7.9) 17.5%(w/v)PEG8000
分辨率 1.81 Å R-free 0.208
7CIS Peptide modification of MHC class I molecules 提交 2020-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;0.1 M TRIS-HCl (pH 7.1), 20.5% (w/v) PEG 8,000
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
7DYN Phosphorylation of MHC I peptide 提交 2021-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M HEPES (pH 7.5), 25% (w/v) PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.208
7N2N TCR-antigen complex AS4.2-PRPF3-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG3350 with 0.2M Potassium phosphate monobasic
分辨率 2.60 Å R-free 0.291
7N2O AS4.2-YEIH-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
突变:C67S GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG3350 with 0.2M Ammonium acetate
分辨率 2.30 Å R-free 0.267
7N2P AS4.3-RNASEH2b-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
突变:C67S GOL GLYCEROL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG3350 with 0.2M Magnesium formate dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
7N2Q AS4.3-YEIH-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;25% PEG3350 with 0.2M Ammonium sulfate and 0.1M BIS-TRIS pH 6.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
7N2Q AS4.3-YEIH-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 H 11–288(278 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;25% PEG3350 with 0.2M Ammonium sulfate and 0.1M BIS-TRIS pH 6.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
7N2R AS4.3-PRPF3-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ASP ASPARTIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;25% PEG3350 with 0.2M Ammonium sulfate and 0.1M BIS-TRIS pH 6.5
分辨率 2.28 Å R-free 0.288
7N2S AS3.1-PRPF3-HLA*B27 提交 2021-05-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;25% PEG3350 with 0.2M Ammonium tartrate dibasic dihydrate
分辨率 2.37 Å R-free 0.311
7T0L HLA-B*27:05 in complex with the pan-HLA-Ia monoclonal antibody W6/32 提交 2021-11-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–286(276 aa)
突变:C67S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;PEG 5000 MME, 0.1 M Bis-Tris pH 6.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.252
7T0L HLA-B*27:05 in complex with the pan-HLA-Ia monoclonal antibody W6/32 提交 2021-11-29 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 11–286(276 aa)
突变:C67S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;PEG 5000 MME, 0.1 M Bis-Tris pH 6.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.252
8CX4 TCR-antigen complex AS8.4-YEIH-HLA*B27 提交 2022-05-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;25% PEG3350 and 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.264
9PBG TCR 19.2 complex with YEIH-HLA B*27:05 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.2 M sodium malonate pH 6.4 17% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.258
9PBH AS19.2 TCR complex with PSG5-HLA B*27:05 提交 2025-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 11–288(278 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.2 M sodium formate; 20% PEG 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.246