当前蛋白身份:A6ZWK1
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4WA6 Structure of yeast SAGA DUBm with Sgf73 N59D mutant at 2.36 angstroms resolution 提交 2014-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–99(99 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;100mM Bis Tris, 18% PEG3350, 100mM Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.244 |
| 4WA6 Structure of yeast SAGA DUBm with Sgf73 N59D mutant at 2.36 angstroms resolution 提交 2014-08-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 G
1–99(99 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;100mM Bis Tris, 18% PEG3350, 100mM Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.244 |
| 4WA6 Structure of yeast SAGA DUBm with Sgf73 N59D mutant at 2.36 angstroms resolution 提交 2014-08-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 C
1–99(99 aa)
链 G
1–99(99 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;100mM Bis Tris, 18% PEG3350, 100mM Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.244 |
| 4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致 |
链 W
1–99(99 aa)
链 b
1–99(99 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol
|
分辨率 3.82 Å R-free 0.256 |
| 4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致 |
链 g
1–99(99 aa)
链 l
1–99(99 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol
|
分辨率 3.82 Å R-free 0.256 |