当前蛋白身份:A6ZWK1 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4WA6 Structure of yeast SAGA DUBm with Sgf73 N59D mutant at 2.36 angstroms resolution 提交 2014-08-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–99(99 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;100mM Bis Tris, 18% PEG3350, 100mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.36 Å R-free 0.244
4WA6 Structure of yeast SAGA DUBm with Sgf73 N59D mutant at 2.36 angstroms resolution 提交 2014-08-28 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 1–99(99 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;100mM Bis Tris, 18% PEG3350, 100mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.36 Å R-free 0.244
4WA6 Structure of yeast SAGA DUBm with Sgf73 N59D mutant at 2.36 angstroms resolution 提交 2014-08-28 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–99(99 aa)
链 G 1–99(99 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;100mM Bis Tris, 18% PEG3350, 100mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.36 Å R-free 0.244
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 W 1–99(99 aa)
链 b 1–99(99 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol
分辨率 3.82 Å R-free 0.256
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 g 1–99(99 aa)
链 l 1–99(99 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol
分辨率 3.82 Å R-free 0.256