当前蛋白身份：A9DF82
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7TT9 Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin C51S C71S Y34F variant 提交 2022-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S, Y34F 突变：C51S, C71S, Y34F 突变：C51S, C71S, Y34F 突变：C51S, C71S, Y34F | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 28% w/v PEG2000 MME
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 8TLS Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin C51S C71S Y108A variant 提交 2023-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S, Y108A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；293 K；27% PEG MME 2000,
100 mM Bis-Tris pH 5.1,
10 mM KCN,
Excluded from light
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.214 |
| 8TLS Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin C51S C71S Y108A variant 提交 2023-07-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S, Y108A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；293 K；27% PEG MME 2000,
100 mM Bis-Tris pH 5.1,
10 mM KCN,
Excluded from light
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.214 |
| 8UGZ Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin C51S C71S variant 提交 2023-10-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CYN CYANIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；23% PEG MME 2000,
100mM Bis-Tris pH 5.5,
10mM KCN,
Excluded from light
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.210 |
| 8UZU Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin L80A C51S C71S variant 提交 2023-11-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S, L80A 突变：C51S, C71S, L80A 突变：C51S, C71S, L80A 突变：C51S, C71S, L80A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CYN CYANIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；293 K；23% PEG MME 2000, 100 mM Bis-Tris pH 5.1, 10 mM KCN
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 8VIJ Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin Y34F C51S C71S variant (cyanomet) 提交 2024-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：Y34F, C51S, C71S 突变：Y34F, C51S, C71S 突变：Y34F, C51S, C71S 突变：Y34F, C51S, C71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CYN CYANIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG MME 2000, 100 mM Bis-Tris pH 6.5, 10 mM KCN
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.201 |
| 8VSH Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin C51S C71S variant with trans heme D 提交 2024-01-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S | A1ADT {3-[(2R,5'R)-9',14'-diethenyl-5'-hydroxy-5',10',15',19'-tetramethyl-5-oxo-4,5-dihydro-3H-spiro[furan-2,4'-[21,22,23,24]tetraazapentacyclo[16.2.1.13,6.18,11.113,16]tetracosa[1,3(24),6,8,10,12,14,16(22),17,19]decaen]-20'-yl-kappa~4~N~21'~,N~22'~,N~23'~,N~24'~]propanoato}iron × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG MME 2000, 10 mM KCN, 18 days in the dark, 43 days exposed to laboratory ambient light
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 8W3A Crystal structure of Shewanella benthica Group 1 truncated hemoglobin C51S C71S variant with trans heme D 提交 2024-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S 突变：C51S, C71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 A1ADT {3-[(2R,5'R)-9',14'-diethenyl-5'-hydroxy-5',10',15',19'-tetramethyl-5-oxo-4,5-dihydro-3H-spiro[furan-2,4'-[21,22,23,24]tetraazapentacyclo[16.2.1.13,6.18,11.113,16]tetracosa[1,3(24),6,8,10,12,14,16(22),17,19]decaen]-20'-yl-kappa~4~N~21'~,N~22'~,N~23'~,N~24'~]propanoato}iron × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG MME 2000, 10 mM KCN, 18 days in the dark, 43 days exposed to laboratory ambient light
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 9YG7 Crystal structure of Shewanella benthica group 1 truncated hemoglobin H24I/C51S/ C71S variant 提交 2025-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–117（116 aa）
链 B
2–117（116 aa）
链 C
2–117（116 aa）
链 D
2–117（116 aa）
|
突变：H24I, C51S, C71S 突变：H24I, C51S, C71S 突变：H24I, C51S, C71S 突变：H24I, C51S, C71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CYN CYANIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1 mM Protein
10 mM KCN
0.1 M Bis-Tris pH 6.5
27% PEG MME 2000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |