当前蛋白身份：B0B9A0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5HAG Structure of Chlamydia trachomatis effector protein ChlaDUB1 提交 2015-12-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–401（272 aa）
片段：UNP residues 130-401
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 20% PEG 8000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 6FDK Structure of Chlamydia trachomatis effector protein Cdu1 bound to ubiquitin 提交 2017-12-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
155–401（247 aa）
|
突变：C174A, C226S, C386A | CL CHLORIDE ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG 20000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 6FDQ Structure of Chlamydia trachomatis effector protein Cdu1 bound to Compound 5 提交 2017-12-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
155–401（247 aa）
|
未记录 | 2UQ N-benzyl-2-[(Z)-iminomethyl]pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；100 mM Bicine pH 9.0, 10% PEG 20000, 2% 1, 4 dioxane
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.284 |
| 6FDQ Structure of Chlamydia trachomatis effector protein Cdu1 bound to Compound 5 提交 2017-12-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
155–401（247 aa）
|
未记录 | 2UQ N-benzyl-2-[(Z)-iminomethyl]pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；100 mM Bicine pH 9.0, 10% PEG 20000, 2% 1, 4 dioxane
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.284 |
| 6FDU Structure of Chlamydia trachomatis effector protein Cdu1 bound to Compound 3 提交 2017-12-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
155–401（247 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；100 mM Bicine pH 9.0, 10% PEG 20000, 2% 1, 4 dioxane
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 6FDU Structure of Chlamydia trachomatis effector protein Cdu1 bound to Compound 3 提交 2017-12-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
155–401（247 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 D5W (2~{S},3~{S})-2-[[(2~{S})-2-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-2-(dimethylamino)ethanoyl]amino]-~{N}-[[2-(iminomethyl)pyrimidin-4-yl]methyl]-3-methyl-pentanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；100 mM Bicine pH 9.0, 10% PEG 20000, 2% 1, 4 dioxane
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 6GZS Structure of Chlamydia trachomatis effector protein ChlaDUB1 bound to ubiquitin 提交 2018-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
130–401（272 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES (pH 6.0), 20% PEG 6000
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分辨率 1.90 Å R-free 0.213 |
| 6GZT Structure of Chlamydia trachomatis effector protein ChlaDUB1 bound to Coenzyme A 提交 2018-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–401（272 aa）
片段：UNP residues 130-401
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未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 COA COENZYME A × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.2), 20% PEG 8000
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分辨率 2.10 Å R-free 0.216 |