当前蛋白身份：B1H241
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6NMG Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain 提交 2019-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–452（452 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 6NMG Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain 提交 2019-01-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–452（452 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 6NMJ Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain, "Paratone-N Immersed" 提交 2019-01-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–452（452 aa）
|
突变：F232Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 6NMJ Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain, "Paratone-N Immersed" 提交 2019-01-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–452（452 aa）
|
突变：F232Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 6TYL Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–491（491 aa）
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突变：Y232F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate
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分辨率 3.30 Å R-free 0.287 |
| 6TYL Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-08-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–491（491 aa）
|
突变：Y232F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.287 |
| 6UKT Cryo-EM structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-10-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–491（491 aa）
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突变：Y232F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.87 Å |
| 6VU8 Structure of G-alpha-i bound to its chaperone Ric-8A 提交 2020-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.14 Å |
| 8ALH X-ray structure of human NCS-1 bound to Ric-8A 提交 2022-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
400–429（30 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30 % PEG 4000, 100 mM sodium acetate pH 4.6, 100 mM magnesium chloride
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分辨率 1.86 Å R-free 0.231 |