当前蛋白身份:B3DIN1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3V44 Crystal structure of the N-terminal fragment of zebrafish TLR5 提交 2011-12-14 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 22–342(321 aa) 片段:zebrafish Toll-like receptor 5b (UNP residues 22-342) and hagfish variable lymphocyte receptor B.61 (UNP residues 126-200)
突变:V24E, L124V, Q159K, R227K, S229T, D334N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;20% MPD, 0.1 M Hepes pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.83 Å R-free 0.238
3V47 Crystal structure of the N-terminal fragment of zebrafish TLR5 in complex with Salmonella flagellin 提交 2011-12-14 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 22–390(369 aa) 片段:zebrafish Toll-like receptor 5b (UNP residues 22-390), hagfish variable lymphocyte receptor B.61 (UNP residues 126-200)
链 B 22–390(369 aa) 片段:zebrafish Toll-like receptor 5b (UNP residues 22-390), hagfish variable lymphocyte receptor B.61 (UNP residues 126-200)
突变:V24E, L124V, Q159K, R227K, S229T, D334N 突变:V24E, L124V, Q159K, R227K, S229T, D334N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;296 K;15% PEG8000, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
分辨率 2.47 Å R-free 0.259
5GY2 Crystal structure of a complex between Bacillus subtilis flagellin and zebrafish Toll-like receptor 5 提交 2016-09-21 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 23–390(368 aa)
突变:V24E/L124V/Q159K/R227K/S229T/D334N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.4;291 K;PEG 300, sodium acetate, pH 4.4
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
5GY2 Crystal structure of a complex between Bacillus subtilis flagellin and zebrafish Toll-like receptor 5 提交 2016-09-21 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 23–390(368 aa)
突变:V24E/L124V/Q159K/R227K/S229T/D334N NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.4;291 K;PEG 300, sodium acetate, pH 4.4
分辨率 2.10 Å R-free 0.236