当前蛋白身份：B4DNT1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
77–197（121 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
77–197（121 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
77–197（121 aa）
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未记录 | A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate
0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5
8% w/v PEG 8000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.286 |
| 9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
77–197（121 aa）
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未记录 | A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate
0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5
8% w/v PEG 8000
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分辨率 3.30 Å R-free 0.286 |