当前蛋白身份:C5MKY7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7EEB Structure of the CatSpermasome 提交 2021-03-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 A 1–239(239 aa)
未记录 NA SODIUM ION × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot for 8 s before plunging
分辨率 2.90 Å
8T1B Cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in apo state 提交 2023-06-02 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 2–239(238 aa)
链 B 2–239(238 aa)
链 C 2–239(238 aa)
链 D 2–239(238 aa)
未记录 9ZR [(2~{R})-2-[(~{Z})-hexadec-9-enoyl]oxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] (~{Z})-docos-13-enoate × 40 YJ0 (2R)-2-{[(4-O-hexopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(25R)-5beta,14beta,17beta-spirostan-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 8 NA SODIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8T1C Cryo-EM structure of human TRPV4 ankyrin repeat domain in complex with GTPase RhoA 提交 2023-06-02 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–239(238 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8T1D Open-state cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in complex with agonist 4a-PDD 提交 2023-06-02 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 2–239(238 aa)
链 B 2–239(238 aa)
链 C 2–239(238 aa)
链 D 2–239(238 aa)
未记录 XS9 (1aR,1bS,4aS,7aS,7bS,8R,9R,9aS)-9a-(decanoyloxy)-4a,7b-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-1,1,6,8-tetramethyl-5-oxo-1a,1b,4,4a,5,7a,7b,8,9,9a-decahydro-1H-cyclopropa[3,4]benzo[1,2-e]azulen-9-yl decanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8T1E Closed-state cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in the presence of 4a-PDD 提交 2023-06-02 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 2–239(238 aa)
链 B 2–239(238 aa)
链 C 2–239(238 aa)
链 D 2–239(238 aa)
未记录 9ZR [(2~{R})-2-[(~{Z})-hexadec-9-enoyl]oxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] (~{Z})-docos-13-enoate × 32 YJ0 (2R)-2-{[(4-O-hexopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(25R)-5beta,14beta,17beta-spirostan-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 8 NA SODIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8T1F Cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in complex with antagonist HC-067047 提交 2023-06-02 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 2–239(238 aa)
链 B 2–239(238 aa)
链 C 2–239(238 aa)
链 D 2–239(238 aa)
未记录 X7N 2-methyl-1-[3-(morpholin-4-yl)propyl]-5-phenyl-N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å