当前蛋白身份:C6K2K4 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7F56 DNQX-bound GluK2-1xNeto2 complex, with asymmetric LBD 提交 2021-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7F57 Kainate-bound GluK2-1xNeto2 complex, at the desensitized state 提交 2021-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7F59 DNQX-bound GluK2-1xNeto2 complex 提交 2021-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7F5A DNQX-bound GluK2-2xNeto2 complex 提交 2021-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
链 F 1–525(525 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
7F5B LBD-TMD focused reconstruction of DNQX-bound GluK2-1xNeto2 complex 提交 2021-06-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 1 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9N4P Composite map for GluK2-1xNeto2 in the apo state 提交 2025-02-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
9N4Q Composite map for GluK2-2xNeto2 in the apo state 提交 2025-02-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
链 F 1–525(525 aa)
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9N4S Composite map for GluK2-1xNeto2 in the open state, in complex with the positive allosteric modulator BPAM344 and agonist kainate 提交 2025-02-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
未记录 KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 17 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19 2J9 4-cyclopropyl-7-fluoro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
9N4T Composite map for GluK2-2xNeto2 in the open state, in complex with the positive allosteric modulator BPAM344 and agonist kainate 提交 2025-02-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–525(525 aa)
链 F 1–525(525 aa)
未记录 2J9 4-cyclopropyl-7-fluoro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 4 KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 18 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å