当前蛋白身份：D0VWZ0
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3N2G TUBULIN-NSC 613863: RB3 Stathmin-like domain complex 提交 2010-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 G2N ethyl [(2R)-5-amino-2-methyl-3-phenyl-1,2-dihydropyrido[3,4-b]pyrazin-7-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；PEG, PIPES BUFFER, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.241 |
| 3N2K TUBULIN-NSC 613862: RB3 Stathmin-like domain complex 提交 2010-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 K2N ethyl [(2S)-5-amino-2-methyl-3-phenyl-1,2-dihydropyrido[3,4-b]pyrazin-7-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；PEG, PIPES BUFFER, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.250 |
| 3RYC Tubulin: RB3 stathmin-like domain complex 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 11 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, LISO4, PIPES BUFFER, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.201 |
| 3RYF GTP-Tubulin: RB3 Stathmin-like domain complex 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, LISO4, PIPES BUFFER, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.208 |
| 3RYH GMPCPP-Tubulin: RB3 Stathmin-like domain complex 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 8 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, LISO4, PIPES BUFFER, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.217 |
| 3RYI GDP-Tubulin: rb3 stathmin-like domain complex 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 12 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；293 K；PEG, LISO4, PIPES BUFFER, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.201 |
| 3UT5 Tubulin-Colchicine-Ustiloxin: Stathmin-like domain complex 提交 2011-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；293 K；PEG, LISO4, PIPES BUFFER, PH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.222 |
| 4DRX GTP-Tubulin in complex with a DARPIN 提交 2012-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–437（437 aa）
片段：UNP residues 1-437
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；292 K；PEG 6K, 0.05M KCl, 0.01 M MGCL2, 0.2M LiCl, 0.01 M HEPES pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.194 |
| 4DRX GTP-Tubulin in complex with a DARPIN 提交 2012-02-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–437（437 aa）
片段：UNP residues 1-437
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；292 K；PEG 6K, 0.05M KCl, 0.01 M MGCL2, 0.2M LiCl, 0.01 M HEPES pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.194 |
| 4EB6 Tubulin-Vinblastine: Stathmin-like complex 提交 2012-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 VLB (2ALPHA,2'BETA,3BETA,4ALPHA,5BETA)-VINCALEUKOBLASTINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；293 K；PEG, Li2SO4, PIPES, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.47 Å R-free 0.253 |
| 4F61 Tubulin:Stathmin-like domain complex 提交 2012-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
链 G
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, NACL, PIPES BUFFER, PH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 4.17 Å R-free 0.261 |
| 4F6R Tubulin:Stathmin-like domain complex 提交 2012-05-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG, MES BUFFER, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.201 |
| 4HNA Kinesin motor domain in the ADP-MG-ALFX state in complex with tubulin and a DARPIN 提交 2012-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, PIPES BUFFER, PH 6.8, 0.8 MM ALCL3, 4 MM NAF, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.211 |
| 4X1I Discovery of cytotoxic Dolastatin 10 analogs with N-terminal modifications 提交 2014-11-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 3WD 2-methyl-L-alanyl-N-[(3R,4S,5S)-3-methoxy-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-1-methoxy-2-methyl-3-oxo-3-{[(1S)-2-phenyl-1-(1,3-thiazol-2-yl)ethyl]amino}propyl]pyrrolidin-1-yl}-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；5% PEG 400, 0.1M LiSO4, 5-7% PEG 20K, 50 mM K-PIPES
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.253 |
| 4X1K Discovery of cytotoxic Dolastatin 10 analogs with N-terminal modifications 提交 2014-11-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 3WZ 2-methyl-L-alanyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S)-1-carboxy-2-phenylethyl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；5% PEG 400, 0.1M LiSO4, 5-7% PEG 20K, 50 mM K-PIPES, pH 6.8 at 19oC
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.263 |
| 4X1Y Discovery of cytotoxic Dolastatin 10 analogs with N-terminal modifications 提交 2014-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 3WV N,2-dimethyl-L-alanyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S)-1-carboxy-2-phenylethyl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；5% PEG 400, 0.1M LiSO4, 5-7% PEG 20K, 50 mM K-PIPES
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.273 |
| 4X20 Discovery of cytotoxic Dolastatin 10 analogs with N-terminal modifications 提交 2014-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 2 3WY 2-methyl-L-prolyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S)-1-carboxy-2-phenylethyl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；5% PEG 400, 0.1M LiSO4, 5-7% PEG 20K, 50 mM K-PIPES
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.252 |
| 5EYP TUBULIN-DARPIN COMPLEX 提交 2015-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG 4000, tri-sodium citrate, ammonium sulfate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 5KX5 Crystal structure of tubulin-stathmin-TTL-Compound 11 complex 提交 2016-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 6YK (2~{S},4~{R})-4-[[2-[(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-3-[[(2~{S},3~{S})-2-[[(2~{R})-1,2-dimethylpyrrolidin-2-yl]carbonylamino]-3-methyl-pentanoyl]-methyl-amino]-4-methyl-pentyl]-1,3-thiazol-4-yl]carbonylamino]-5-(4-aminophenyl)-2-methyl-pentanoic acid × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；precipitant solution: 3% PEG 4K, 4-6% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES/Imidazole pH 6.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 6GVM Tubulin:F3II DARPin complex 提交 2018-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG5000MME, Mes pH 6.0, 150 mM AMMONIUM SULFATE, 50 mM KCl
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.270 |
| 6GVN Tubulin:TM-3 DARPin complex 提交 2018-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG5000 MME, 0.1 M Mes pH 6.0, 150 mM AMMONIUM SULFATE
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.216 |
| 6GX7 Tubulin-CopN-alphaRep complex 提交 2018-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；polyethylene glycol 400, 0.1 M Mes
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.210 |
| 6GX7 Tubulin-CopN-alphaRep complex 提交 2018-06-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；polyethylene glycol 400, 0.1 M Mes
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.210 |
| 8CGZ tubulin-AB8939 complex 提交 2023-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 UIY AB-8939 × 2 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG, LiSO4, PIPES BUFFER, pH 6.80
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.235 |
| 9F07 TUBULIN:STATHMIN:DARPIN:TAU MTBR3 COMPLEX 提交 2024-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 E
1–451（451 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；20 to 25% (w/v) polyethylene glycol 3350
0.2 M K/Na tartrate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.234 |