当前蛋白身份:D3ZIM6 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:35-meric(35) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:35-meric(35) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:35-meric(35) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 f 1–98(98 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å