当前蛋白身份：D6QLY0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5NUP Structural basis for maintenance of bacterial outer membrane lipid asymmetry 提交 2017-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
22–365（344 aa）
链 B
22–365（344 aa）
链 C
22–365（344 aa）
|
未记录 | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 19 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.04 M magnesium chloride hexahydrate, 0.05 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH7.5 and 32 % PEG400
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.290 |
| 5O79 Klebsiella pneumoniae OmpK36 提交 2017-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–365（344 aa）
链 B
22–365（344 aa）
链 C
22–365（344 aa）
|
未记录 | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 9 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.08 M Magnesium Acetate tetrahydrate , 0.1 M sodium citrate, 14% w/v 5000 PEG MME
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.190 |
| 6RD3 Crystal structure of the wild type OmpK36 from Klebsiella pneumonia 提交 2019-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–365（344 aa）
链 B
22–365（344 aa）
链 C
22–365（344 aa）
|
突变：G0 突变：G0 突变：G0 | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 17 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Lithium sulfate, 0.1M sodium citrate pH 5.6 and 12% PEG4000
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.234 |
| 6RD3 Crystal structure of the wild type OmpK36 from Klebsiella pneumonia 提交 2019-04-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–365（344 aa）
链 E
22–365（344 aa）
链 F
22–365（344 aa）
|
突变：G0 突变：G0 突变：G0 | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 12 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Lithium sulfate, 0.1M sodium citrate pH 5.6 and 12% PEG4000
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.234 |
| 7PZF Crystal structure of the OmpK36 TD insertion chimera from Klebsiella pneumonia 提交 2021-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–365（344 aa）
链 B
22–365（344 aa）
链 C
22–365（344 aa）
|
突变：T115 and D116 insertion 突变：T115 and D116 insertion 突变：T115 and D116 insertion | LI LITHIUM ION × 3 C14 TETRADECANE × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M Lithium sulfate, 0.1 M Sodium citrate, and 10% PEG 4000 (pH 5.6)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.205 |
| 7PZF Crystal structure of the OmpK36 TD insertion chimera from Klebsiella pneumonia 提交 2021-10-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–365（344 aa）
链 E
22–365（344 aa）
链 F
22–365（344 aa）
|
突变：T115 and D116 insertion 突变：T115 and D116 insertion 突变：T115 and D116 insertion | LI LITHIUM ION × 6 C14 TETRADECANE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M Lithium sulfate, 0.1 M Sodium citrate, and 10% PEG 4000 (pH 5.6)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.205 |
| 7Q3T Crystal structure of the OmpK36 D insertion chimera from Klebsiella pneumonia 提交 2021-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–365（344 aa）
链 B
22–365（344 aa）
链 C
22–365（344 aa）
|
突变：D115 insertion 突变：D115 insertion 突变：D115 insertion | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 28 LI LITHIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M Lithium sulfate, 0.1 M Sodium citrate, and 10% PEG 4000 (pH 5.6)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.213 |
| 7Q3T Crystal structure of the OmpK36 D insertion chimera from Klebsiella pneumonia 提交 2021-10-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–365（344 aa）
链 E
22–365（344 aa）
链 F
22–365（344 aa）
|
突变：D115 insertion 突变：D115 insertion 突变：D115 insertion | C8E (HYDROXYETHYLOXY)TRI(ETHYLOXY)OCTANE × 19 LI LITHIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M Lithium sulfate, 0.1 M Sodium citrate, and 10% PEG 4000 (pH 5.6)
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.213 |
| 7SZI Cryo-EM structure of OmpK36-TraN mating pair stabilization proteins from carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae 提交 2021-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
22–365（344 aa）
链 B
22–365（344 aa）
链 C
22–365（344 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；SEC Buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |