当前蛋白身份:D7SFB8 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8PZ3 TssM - A USP-like DUB from B. pseudomallei (193-430) 提交 2023-07-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 192–490(299 aa)
链 B 192–490(299 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.15 M ammonium chloride, 22 % w/v PEG 3350 and 4 % Dextran sulfate sodium salt Mr 5,000; 1:2, 1:1, 2:1 protein reservoir drop ration; cryoprotected with reservoir + 25% Glycerol
分辨率 3.15 Å R-free 0.275
8Q00 TssM-Ub-PA complex - A USP-like DUB from B. pseudomallei (193-430) reacted with Ub-PA 提交 2023-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 192–490(299 aa)
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2 M ammonium citrate dibasic and 22 % w/v PEG 3350; 1:2, 1:1, 2:1 protein:reservoir ration; cryoprotected with reservoir + 25% ethylene glycol
分辨率 1.62 Å R-free 0.198
8Q00 TssM-Ub-PA complex - A USP-like DUB from B. pseudomallei (193-430) reacted with Ub-PA 提交 2023-07-27 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 192–490(299 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2 M ammonium citrate dibasic and 22 % w/v PEG 3350; 1:2, 1:1, 2:1 protein:reservoir ration; cryoprotected with reservoir + 25% ethylene glycol
分辨率 1.62 Å R-free 0.198