当前蛋白身份:D7Z9G5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5U9F 3.2 A cryo-EM ArfA-RF2 ribosome rescue complex (Structure II) 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 13
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 360 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 5U9G 3.2 A cryo-EM ArfA-RF2 ribosome rescue complex (Structure I) 提交 2016-12-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 13
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 348 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6OGF 70S termination complex with RF2 bound to the UGA codon. Partially rotated ribosome with RF2 bound (Structure III). 提交 2019-04-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 k
1–123(123 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6OGG 70S termination complex with RF2 bound to the UGA codon. Rotated ribosome with RF2 bound (Structure IV). 提交 2019-04-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 k
1–123(123 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6OGI 70S termination complex with RF2 bound to the UAG codon. Rotated ribosome conformation (Structure V) 提交 2019-04-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致 |
链 k
1–123(123 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6OM6 Structure of trans-translation inhibitor bound to E. coli 70S ribosome with P site tRNA 提交 2019-04-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | KKL 4-amino-N-[5-(4-ethynylphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot time: 3.5 seconds
|
分辨率 3.10 Å |
| 6ORE Release complex 70S 提交 2019-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 436 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6ORL RF1 pre-accommodated 70S complex at 24 ms 提交 2019-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 295 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6OSK RF1 accommodated 70S complex at 60 ms 提交 2019-05-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 307 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6OSQ RF1 accommodated state bound Release complex 70S at long incubation time point 提交 2019-05-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 436 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6OST RF2 pre-accommodated state bound Release complex 70S at 24ms 提交 2019-05-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6OT3 RF2 accommodated state bound Release complex 70S at 24 ms 提交 2019-05-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6OUO RF2 accommodated state bound 70S complex at long incubation time 提交 2019-05-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VU3 Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing mRNA with a 12 nt long spacer 提交 2020-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYQ Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing an 15 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYR Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing an 18 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6VYS Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing a 21 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYT Escherichia coli transcription-translation complex A2 (TTC-A2) containing a 15 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:64-meric(64) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 14.00 Å |
| 6VYU Escherichia coli transcription-translation complex C2 (TTC-C2) containing a 27 nt long mRNA spacer 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6VYW Escherichia coli transcription-translation complex C3 (TTC-C3) containing mRNA with a 27 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6VYX Escherichia coli transcription-translation complex C4 (TTC-C4) containing mRNA with a 21 nt long spacer, transcription factor NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VYY Escherichia coli transcription-translation complex C5 (TTC-C5) containing mRNA with a 21 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VYZ Escherichia coli transcription-translation complex C6 (TTC-C6) containing mRNA with a 21 nt long spacer, NusA, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VZ2 Escherichia coli transcription-translation complex D1 (TTC-D1) containing mRNA with a 27 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 6VZ3 Escherichia coli transcription-translation complex D2 (TTC-D2) containing mRNA with a 27 nt long spacer 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 6VZ5 Escherichia coli transcription-translation complex D3 (TTC-D3) containing mRNA with a 21 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 6VZ7 Escherichia coli transcription-translation complex C1 (TTC-C1) containing a 27 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6VZJ Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing mRNA with a 15 nt long spacer, fMet-tRNAs at E-site and P-site, and lacking transcription factor NusG 提交 2020-02-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6X6T Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B1 (TTC-B1) containing an mRNA with a 24 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-05-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6X7F Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B2 (TTC-B2) containing an mRNA with a 24 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-05-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6X7K Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B3 (TTC-B3) containing an mRNA with a 24 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-05-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6X9Q Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B3 (TTC-B3) containing an mRNA with a 27 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-06-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6XDQ Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B3 (TTC-B3) containing an mRNA with a 30 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6XDR Escherichia coli transcription-translation complex B (TTC-B) containing an 27 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:67-meric(67) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 6XGF Escherichia coli transcription-translation complex B (TTC-B) containing an 30 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:67-meric(67) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 6XII Escherichia coli transcription-translation complex B (TTC-B) containing an 24 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:67-meric(67) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6XIJ Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing an 24 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 t
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 7K00 Structure of the Bacterial Ribosome at 2 Angstrom Resolution 提交 2020-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 j
1–123(123 aa)
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 309 SPD SPERMIDINE × 16 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.98 Å |
| 7LVK Cfr-modified 50S subunit from Escherichia coli 提交 2021-02-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 S
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 179 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Buffer A
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot Force 5
Blot Time 10sec
Hum 95%
Temperature 10C
Waiting time 1 min
|
分辨率 2.20 Å |
| 7M5D Cryo-EM structure of a non-rotated E.coli 70S ribosome in complex with RF3-GTP, RF1 and P-tRNA (state I) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7S1G wild-type Escherichia coli stalled ribosome with antibiotic linezolid 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 S
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 196 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å |
| 7S1H Wild-type Escherichia coli ribosome with antibiotic linezolid 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致 |
链 S
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 206 ZLD N-{[(5S)-3-(3-fluoro-4-morpholin-4-ylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.35 Å |
| 7SA4 Damaged 70S ribosome with PrfH bound 提交 2021-09-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致 |
链 K
1–123(123 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 439 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å |