当前蛋白身份:E5RFS5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7D7S HIV-1 SF2 Nef in complex with the Fyn SH3 R96I mutant 提交 2020-10-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 82–144(63 aa)
突变:R96I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.10 M calcium acetate hydrate, 0.10 M sodium acetate buffer (pH 4.5), 10% w/v PEG 4000
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.10 M calcium acetate hydrate, 0.10 M sodium acetate buffer (pH 4.5), 10% w/v PEG 4000
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.10 M calcium acetate hydrate, 0.10 M sodium acetate buffer (pH 4.5), 10% w/v PEG 4000
分辨率 3.32 Å R-free 0.300
7D7S HIV-1 SF2 Nef in complex with the Fyn SH3 R96I mutant 提交 2020-10-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 82–144(63 aa)
突变:R96I 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.10 M calcium acetate hydrate, 0.10 M sodium acetate buffer (pH 4.5), 10% w/v PEG 4000
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.10 M calcium acetate hydrate, 0.10 M sodium acetate buffer (pH 4.5), 10% w/v PEG 4000
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.10 M calcium acetate hydrate, 0.10 M sodium acetate buffer (pH 4.5), 10% w/v PEG 4000
分辨率 3.32 Å R-free 0.300
7UD6 Designed Enzyme SH3-588 (Catechol O-methyltransferase catalytic domain and Src homology 3 binding domain fusion) 提交 2022-03-18 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 86–141(56 aa)
突变:Q26V,N29R,E37L,R39V,R73E,Y74F,Q77L,N78V,T93Q,Q97Y,K98R SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;297 K;0.7 M magnesium formate, 0.1 M bis-tris propone pH 7.0.
分辨率 2.59 Å R-free 0.278